本发明公开了一种烟气凝结废水及脱硫废水回收利用系统及方法，所述系统包括依次设置的预处理系统、浓缩系统和结晶系统；其中，所述预处理系统包括脱硫废水预处理装置、凝结废水预处理装置和凝结水反渗透处理装置，所述浓缩系统采用全热空预器，所述全热空预器内从上至下依次设置上段喷淋器、上段淋水蒸发盘管、风帽、下段喷淋器、下段淋水蒸发盘管；所述结晶系统包括硫酸钠结晶器和氯化钠结晶器；本发明提供的系统在进行浓缩前，对脱硫废水和烟气凝结废水分别进行了预处理，可以有效去除脱硫废水和烟气凝结废水中的钙镁离子、重金属离子等，最终得到的结晶盐几乎不含有杂质，凝结废水及脱硫废水全部实现资源化回收利用，实现零排放。