本发明公开了一种考虑新能源不确定性的输配协同优化调度方法。以输配电网之间交互功率的极限值为目标函数，建立考虑价格型和激励型柔性负荷的最优潮流模型，基于KKT条件构建配电网交互功率与新能源输入解析映射关系；利用高斯混合模型表征风电和光伏新能源出力向量的概率特征，对交互功率概率分布进行非参数化估计；结合交互功率极限值的累计概率分布函数，将交互功率的机会约束转化为线性约束添加到上层模型中，构建输配协同双层优化调度模型，基于KKT条件将上下双层模型转化为单层模型进行求解。与传统的独立优化方法相比，本发明提出考虑新能源不确定性的输配协同优化调度方法，具有更强的实用性，对电力系统的安全运行调度具有重要意义。