本发明涉及液态奶技术领域，具体提供一种添加母乳低聚糖的儿童配方牛奶及其制备方法。本发明所提供的儿童配方牛奶的原料包括：牛乳、炼乳、磷脂、复合营养素（维生素和矿物质）、乳清蛋白粉和益生元，所述益生元中包括母乳低聚糖、低聚半乳糖和低聚果糖。本发明所述益生元的添加解决了营养素添加导致的牛奶不良风味和体系不稳定的问题。本发明还提供了稳定性高的儿童配方牛奶制备方法，本发明所提供的儿童配方牛奶为儿童提供主要营养需求，还具备增强免疫力、调节肠道菌群的作用。