本发明公开了一种轨道交通变流器综合检测系统，包括直流电源系统，用于为被试变流器提供功率考核试验所需电源；主变单相电源系统，用于为机车牵引变流器提供轻载联调电源；辅变单相电源系统，用于为机车辅变和列供柜提供考核试验电源；主变负载系统，用于为机车牵引变流器和地铁牵引变流器提供负载；辅变负载系统，用于为机车辅助变流器以及地铁辅助变流器提供负载；水冷系统，用于为机车牵引变流器提供水路冷却；风冷系统，用于地铁牵引变流器散热模拟走行风用；辅助配电系统，用于提供辅助电源。本发明能够兼容多种型号变流器等产品测试，提升设备的兼容性，减少多个设备开发与投入。