本发明涉及FPGA升级技术领域，具体涉及一种基于MicroBlaze的FPGA在线升级方法、系统及介质，在FPGA内嵌入MicroBlaze，上位机将固件数据转换为TLV格式；上位机通过UART接口或ETH接口将TLV数据包传输至MicroBlaze；MicroBlaze通过AXI UART LITE接口或AXI ETH接口接收数据包，并对数据包处理；MicroBlaze通过AXI SPI接口将解析后的数据写入FLASH；本发明通过TLV格式的数据封装和处理，并在写入数据之前和之后进行校验，确保了数据的准确性和完整性，从而提高了升级过程的可靠性。