本发明公开了一种细胞形态纤长化的重组骆驼刺泛菌及其构建方法和应用。所述重组骆驼刺泛菌通过敲除出发菌株骆驼刺泛菌Pantoea alhagi XK‑11基因组中的minc基因得到。所述的敲除是利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除。本发明通过CRISPR/Cas9技术敲除所述基因minc，获得重组骆驼刺泛菌△minc P.alhagi XK‑11，使得出发菌株骆驼刺泛菌的细胞长度显著增长，可实现更快的离心分离即可实现菌体收集，很好的简化下游处理流程，降低下游处理成本。