本发明涉及遥感技术领域，公开了针对山地遥感植被指数的时序滤波算法、装置及存储介质，包括获取植被指数数据集；根据场景质量分类图栅格文件，获取掩膜栅格文件；利用掩膜栅格文件标记无效像元，并对植被指数数据集进行计算，获取时序滤波重构结果。上述的针对山地遥感植被指数的时序滤波算法、装置及存储介质，基于Sentinel‑2卫星数据，结合线性内插与S‑G滤波算法，建立一种植被指数数据集时序重构算法，该算法能够显著改善长时间序列山地植被指数数据集受云雪及云阴影影响情况，在保证数据真实性的基础上根据时序数据逐像元计算合适的模拟值，使数据集具有良好的空间连续性，显著提升数据集的质量与可用性，以精细化表征山地植被随时间变化趋势。