本发明公开了一种高速公路隧道互通受限区域风险评估方法及管控系统，涉及交通安全控制技术领域。该方法包括步骤：获取隧道互通受限区域道路数据、实时交通数据与环境感知数据；利用间距受限路段安全评价模型处理获取的数据，并评估为路段当下的安全等级；在受限路段的当下安全等级为低或中时，对路段未来一段时间的安全等级变化进行预测，根据安全等级预测结果在上游路段采取不同的管控方案；根据受限区域的安全等级预测结果，对上游车辆进行定向预警，并将预警结果进行反馈分析。本发明能够实现更智能、更准确、更高效的隧道风险预测和主动预警，从而为高速公路隧道交通安全提供更可靠的保障。