发明公开了数字式钢轨焊缝超声波探伤仪自动校准系统及校准方法，包括校准控制终端、程控衰减器以及与被测超声波探伤仪连接的标准信号发生模块，被测超声波探伤仪通过固定衰减器与标准信号发生模块的同步触发输入端连接，标准信号发生模块的信号输出端通过程控衰减器与被测超声波探伤仪的信号输入端连接，其自动校准方法包括，根据预定设置信息设置校准参数和生成选通命令以及自动选通通信号通道，基于已建立的通信连接预设校准测试通道，基于衰减控制信号控制标准信号发生模块产生的标准校准信号输入至被检超声波探伤仪对预校准参数信号进行对比校准。本发明能够满足用户对检定工作标准化的要求，提高了校准工作质量，大大提高了校准效率。