本发明涉及通信加密领域，尤其涉及一种基于时域密钥的物理层加密方法；技术问题：采用固定不变且已知的序列作为信号通讯的加密解码的参考信号，窃听者可以通过时域滑窗等手段，实现网络驻留窃取数据，从而容易产生数据被盗取的情况，对物理层数据交互缺乏加密保护手段，存在安全风险；技术方案：一种基于时域密钥的物理层加密方法，包括有通过随机密钥产生器，周期性地生成密钥；本发明相对于现有技术采用固定不变且已知的序列作为信号通讯的加密解码的参考信号，存在安全风险，本加密方法使用不断变化的参考信号进行相位调整的方法增加了物理层数据传输被监听的难度，既提高物理层数据交互的安全性，又对物理层数据的传输起到了保护的作用。