本发明公开了一种无人机载雷达近区抗干扰波形设计方法及系统，涉及雷达波形设计技术领域。本发明的技术要点包括：对于无人机载雷达系统，构造基于正交频分复用技术的预编码波形集合；构造波形优化约束条件；构造波形优化目标函数和参考雷达波形；利用MM算法对波形优化目标函数进行转化，并将波形优化约束条件中非凸约束条件转化为凸约束条件；利用标准数值工具迭代求解转化后的波形优化目标函数，获得最优波形序列。本发明避免了常见的低峰均比约束未能充分控制发射天线功率均匀性的问题，防止高功率动态范围波动和低发射功率效率的情况，本发明在符号误码率和平均可实现的速率方面有显著改善，且提升了抗截获性能，具备更低的相关旁瓣水平。