本申请提供以棉籽壳为基质的黑曲霉培养物及制备方法，黑曲霉孢子接种于由棉籽壳、麸皮、氨水和水按比例配成的发酵基质中进行厌氧发酵所得培养物；其中，棉籽壳、麸皮、氨水的质量比为95：3‑4：0.5‑1，料水比为1:1‑1:1.2。制备的黑曲霉培养物富含酸性蛋白酶和纤维素酶能够分解动物饲料中的蛋白质和纤维素，从而提高动物的消化吸收能力。黑曲霉培养物中的黑曲霉孢子及其他微生物成分，能够调节动物体内的微生态平衡。通过提高动物的消化吸收能力和调节体内微生态平衡，能够间接增强动物的防病抗病能力，减少动物疾病的发生，提高养殖效益。