本发明涉及抗体检测技术领域，具体涉及一种工程菌、融合蛋白及其制备方法和应用；通过TAF9基因及pGEX‑4T‑1载体质粒进行酶切得到pGEX‑4T‑1/TAF9重组质粒，采用所述pGEX‑4T‑1/TAF9重组质粒转化感受态细胞Rosetta(DE3)，得到pGEX‑4T‑1/TAF9/Rosetta(DE3)菌株并通过蛋白表达与纯化方法构建pGEX‑4T‑1/TAF9/Rosetta(DE3)工程菌，表达纯化得到GST‑TAF9融合蛋白，利用ELISA方法实现检测SLE患者中是否有抗TAF9抗体产生，为研究抗TAF9抗体在SLE发病中的作用奠定基础。