本发明公开一种基于九相逆变器的无轴承电机控制系统，主要包括：九相逆变器、悬浮绕组磁链观测器、转矩绕组磁链观测器、空间矢量脉宽调制模块、力‑磁转换模块、无轴承电机以及调节器。将传感器检测无轴承电机的信号与原始给定信号在PID控制器中进行对比，再将差值信号与观测器观测出的信号共同输送至转换模块，然后通过空间矢量脉宽调制，接着将信号进行处理，通过九相逆变器的集成控制模块的设计，对一套控制系统的分级调制，最终达到对无轴承电机转矩与悬浮的分别控制。本发明在保障了无轴承电机的转矩与悬浮控制的同时，还降低了无轴承电机控制系统的复杂性，增加了控制系统的灵活性与容错能力，增加了空间利用率。