本发明提供一种适用于软土地区不等深相邻基坑的施工方法，通过在深基坑围护结构内以及浅基坑围护结构内同期向下开挖第一深度并拆除第一深度对应的共有基坑围护结构，在第一深度对应的位置同期施作浅基坑底板以及倒牛腿连接结构，浅基坑底板和倒牛腿连接结构共同浇筑为整体结构，继续在深基坑围护结构内向下开挖第二深度，并在剩余共有基坑围护结构的顶部施作冠梁，在深基坑围护结构内继续向下开挖第三深度，并施作深基坑底板和剩余主体结构。本申请不需要单独施作深基坑和浅基坑，可以采用同期施工方式进行施作得到，能够大幅提高施工效率，降低工程成本。