本发明涉及一种新能源汽车CAN通信协议自适应识别方法、系统及终端，涉及CAN通信协议技术领域，其包括：设备上电后，于预设的等待时间后轮询判断CAN总线上的波特率检测值；于确定正确的波特率检测值后，实时获取CAN总线上正常数据的通信数据帧；基于通信数据帧与预设的通信协议数据库进行自适应调节匹配以形成匹配结果信息；根据匹配结果信息分析确定兼容异常预警信息或通信连接控制信息，并输出兼容异常预警信息或通信连接控制信息。本发明具有提高各个产品之间的通用性的效果。