本实用新型公开了一种多道式蛋白多肽超滤离心管，包括第一超滤离心管，所述第一超滤离心管的顶部螺纹连接有端盖，所述第一超滤离心管的底部固定连接有多个相互卡接的第二超滤离心管，位于最下方的第二超滤离心管的底部固定连接有收集管，本实用新型结构简单，将样本加入第一超滤离心管中，然后将第二超滤离心管和收集管分别固定，其中第一超滤离心管和第二超滤离心管的底部均设有不同孔径的超滤膜，第二超滤离心管可以根据实际需要分离的不同分子量阶的多肽进行调整，可以增加或减少第二超滤离心管的数量获得多个不同分子量阶段的多肽，当样本离心结束后将第一超滤离心管、第二超滤离心管和收集管中的样本取出保存。