本实用新型提供一种波导对接夹具，包括相对设置的第一法兰盘和第二法兰盘，所述第一法兰盘用于安装第一波导管，所述第二法兰盘用于安装第二波导管；所述第一法兰盘和第二法兰盘的上下两端均开设有用于安装导轨的安装孔；所述第一法兰盘和第二法兰盘均通过第一螺丝与所述导轨固定连接。本实用新型通过榫卯结构实现法兰盘一和法兰盘二的快速连接，简便牢固；通过导轨可使法兰盘一和法兰盘二处于同一高度，并实现法兰盘的快速连接。本实用新型拆装容易，大大增加了波导使用寿命。