本实用新型公开了一种双微控器的电动车控制系统，包括：高压区域控制单元，与高压动力电池、电机连接，用于控制整车动力；低压区域控制单元，与低电压蓄电池、外部部件连接，用于采集外部部件的信号；隔离单元，其两端分别连接所述高压区域控制单元、所述低压区域控制单元。本实用新型采用双控制单元的方案，可以降低控制成本，同时，双控制单元通过不同的供电系统供电，可以降低同时失效的风险，采用隔离单元对高压区域控制单元、低压区域控制单元进行分离，可以显著提高车辆的安全性。