一種の中性子捕捉療法システム(100)は、荷電粒子ビーム(P)を発生するための加速器(200)、荷電粒子ビーム(P)と反応して中性子ビーム(N)を発生する中性子発生部(10)及びビーム整形体(20)を含み、前記ビーム整形体(20)は収容部(21)、減速体(22)、反射体(23)、熱中性子吸収体(24)、放射遮蔽(25)及び射束出口(26)を含み、収容部(21)には加速器(200)に接続する真空管(30)が設けられ、真空管(30)は加速器(200)によって加速された後の荷電粒子ビーム(P)を中性子発生部に転送して、中性子発生部が荷電粒子ビーム(P)と反応して中性子を発生でき、中性子発生部(10)は第一位置と第二位置の間に運動し、第一位置において、中性子発生部(10)が荷電粒子ビーム(P)と反応して中性子を発生することができ、第二位置において、中性子発生部(10)がビーム整形体(20)から脱落する。即ち、中性子発生部(10)が有する部分真空管(30)を取り外すことで中性子発生部(10)をビーム整形体(20)の中から脱落し、作業者が核反応の発生した後の中性子発生部(10)との間の直接な接触を減少して、作業者の放射線のリスクを低減する。