본 발명은 소정의 팬과 상기 팬의 제동장치를 각기 제어하는 콘트롤러와, 전기에너지를 충전하는 배터리를 구비한 하이브리드 건설기계 배터리 충전 시스템의 충전 방법에 있어서, 상기 콘트롤러가 현재 냉각수 온도, 유압유 온도, 엔진 흡입 공기 온도에 따라 구한 현재 목표 팬 회전 속도가 측정시의 실제 팬 회전 속도 보다 작은 경우 상기 목표 회전 속도까지 상기 팬 회전 속도를 감소시키도록 상기 제동장치를 제어하는 단계 및, 상기 제어를 통해 상기 제동장치에 의해 상기 팬의 회전속도가 상기 측정시의 실제 팬 회전 속도에서 상기 목표 회전 속도까지 감소될 때 발생되는 회전력에 의한 전기에너지를 배터리에 충전하는 단계를 포함하여 이루어진 팬의 회전력을 이용한 하이브리드 건설기계의 배터리 충전 시스템의 충전 방법 및 그 시스템에 관한 것으로, 팬의 회전력에 의해 발생된 전기에너지를 배터리에 저장하여 엔진 가동 시간을 줄이므로 연비 절감 효과를 얻을 수 있다.