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公开(公告)号：CN103773890B
公开(公告)日：2016-02-03
申请号：CN201410060083.3
申请日：2014-02-21
申请人： 中国农业科学院棉花研究所 , 安阳工学院 , 河北农业大学
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： 本发明属于分子细胞遗传学领域，具体涉及一种鉴别棉花A基因组或A亚基因组染色体的方法。用来源于海岛棉pima-90BAC文库的BAC克隆299N22，在不同棉种中进行BAC-FISH，可明显分辨出棉花A基因组或A亚基因组染色体。以该BAC克隆做探针在5个四倍体棉种的A亚基因组染色体和2个二倍体棉种的A基因组染色体上均表现出明显信号，且信号分布在所有染色体上，而在D基因组和D亚基因组染色体均无信号。利用本发明的BAC克隆采用BAC-FISH方法，可快速鉴别A基因组或A亚基因全套组染色体。
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公开(公告)号：CN103773890A
公开(公告)日：2014-05-07
申请号：CN201410060083.3
申请日：2014-02-21
申请人： 中国农业科学院棉花研究所 , 安阳工学院 , 河北农业大学
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6841 , C12Q2543/10
摘要： 本发明属于分子细胞遗传学领域，具体涉及一种鉴别棉花A基因组或A亚基因组染色体的方法。用来源于海岛棉pima-90BAC文库的BAC克隆299N22，在不同棉种中进行BAC-FISH，可明显分辨出棉花A基因组或A亚基因组染色体。以该BAC克隆做探针在5个四倍体棉种的A亚基因组染色体和2个二倍体棉种的A基因组染色体上均表现出明显信号，且信号分布在所有染色体上，而在D基因组和D亚基因组染色体均无信号。利用本发明的BAC克隆采用BAC-FISH方法，可快速鉴别A基因组或A亚基因全套组染色体。
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公开(公告)号：CN106701916A
公开(公告)日：2017-05-24
申请号：CN201611022229.0
申请日：2016-11-17
申请人： 安阳工学院 , 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6841 , C12Q1/6811 , C12Q2563/107 , C12Q2537/159 , C12Q2531/113
摘要： 本发明公开了一种棉花体细胞染色体Oligo‑FISH方法，与现有技术相比，本发明根据公布的棉花基因组序列信息，设计单染色体的寡核苷酸混合池，寡核苷酸混合池经过乳化PCR扩增、体外转录、反转录，获得荧光标记的ssDNA混合池，即目标染色体的寡核苷酸混合探针。以此探针对棉花体细胞中期染色体进行荧光原位杂交(FISH)，建立棉花寡核苷酸FISH方法(Oligo‑FISH)，为棉花染色体DNA重排、染色体配对、亲缘关系分析、异源染色质鉴定等提供技术支持。
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公开(公告)号：CN113046291B
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202110181753.7
申请日：2021-02-09
申请人： 安阳工学院 , 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12N5/04
摘要： 本发明涉及一种用于单细胞转录组测序的亚洲棉根尖细胞与叶肉细胞原生质体的解离方法，该方法包括亚洲棉种子的萌发、组织培养、酶解解离原生质体、离心收集原生质体以及显微观察鉴定等步骤。本发明从亚洲棉的根尖和叶片所解离的原生质体浓度较高(高于3000cells/μL)，且活率不低于92％，完全符合10×Genomics单细胞转录组测序的上机要求。因此本发明得出的根尖与叶片解离原生质体的方法，更好的解决了亚洲棉根尖细胞与叶肉细胞原生质体解离困难以及活率低的难题，从而可以更好的研究棉花抗逆过程特定基因的表达，对于棉花的遗传发育与培育抗逆棉花的品种至关重要。
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公开(公告)号：CN115927548A
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202210911280.6
申请日：2022-07-29
申请人： 安阳工学院 , 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6841 , C12Q1/6806 , A01H4/00
摘要： 本发明涉及一种用于亚洲棉根尖基因定位研究的RNA原位杂交方法。首先，根据亚洲棉幼根的稚嫩特性，改进了植物组织培养、取材、固定与脱水等方法，更加完善的保证了组织目标部位的结构完整性；其次，为进一步探索并优化一种适合亚洲棉根尖基因定位的RNA原位杂交方法，对切片的制备、切片预处理、预杂交、杂交以及杂交后处理等方面都进行了改进，从而可以保证亚洲棉根尖特异基因定位的准确性、特异性以及高效性，更加适合应用到亚洲棉根尖单细胞转录组测序的标记基因定位中去。本发明提供的RNA原位杂交方法是首次运用到棉花根尖基因定位的RNA原位杂交方法，具有很大的创新性与适用性。
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公开(公告)号：CN104212888B
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201410409161.6
申请日：2014-08-19
申请人： 中国农业科学院棉花研究所 , 安阳工学院 , 河北农业大学
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： 本发明属于分子细胞遗传学领域，具体涉及一种特异性标记棉花A genome和A sub-genome染色体端部的方法。用来源于海岛棉pima-90BAC文库的BAC克隆350B21，在不同棉种的有丝分裂中期染色体上进行BAC-FISH，发现在A genome和A sub-genome所有染色体的端部有较强烈杂交信号，而在D genome和D sub-genome所有染色体上杂交信号不明显。利用本发明的BAC克隆采用BAC-FISH方法，可快速有效标记棉花A genome和A sub-genome染色体端部。
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公开(公告)号：CN117347126A
公开(公告)日：2024-01-05
申请号：CN202311189793.1
申请日：2023-09-15
申请人： 安阳工学院 , 中国农业科学院棉花研究所
摘要： 本发明公开了一种用于棉花幼根空间转录组学分析的冷冻切片方法，选用霍格兰营养液对棉花幼苗进行水培培养，接着对棉花根尖样品切段、变性固定、蔗糖脱水保护、包埋、预冷、切片和制片，给出了一套用于棉花幼根空间转录组学分析的冷冻切片方法，通过固定液固定和蔗糖脱水保护后直接包埋与切片，得到组织完整且细胞结构清晰的组织切片，避免了细胞结构的损失和细胞内成分的流失，是目前技术先进的一种适用于棉花根尖空间转录组学分析的效果良好的冷冻切片方法。
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公开(公告)号：CN104318131A
公开(公告)日：2015-01-28
申请号：CN201410533062.9
申请日：2014-10-11
申请人： 中国农业科学院棉花研究所 , 安阳工学院
摘要： 本发明属于生物信息学领域，具体涉及电子FISH的方法。所述方法包括步骤：)以探针序列作为检索序列，以靶序列作为数据库序列，进行序列比对；用Perl脚本blast_parser.pl修饰比对结果；删除比对结果中片段偏短、一致性偏差的结果；以探针序列及检索序列靶序列上的位置为纵坐标，以比对次数为横坐标做散点图。该方法操作简单方便，且用真实FISH验证其结果，证明其结果可靠精确，节约了时间和成本，且靶DNA可以是基因组、单染色体、特定序列片段等，分辨率高且针对性较强。
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公开(公告)号：CN113046291A
公开(公告)日：2021-06-29
申请号：CN202110181753.7
申请日：2021-02-09
申请人： 安阳工学院 , 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12N5/04
摘要： 本发明涉及一种用于单细胞转录组测序的亚洲棉根尖细胞与叶肉细胞原生质体的解离方法，该方法包括亚洲棉种子的萌发、组织培养、酶解解离原生质体、离心收集原生质体以及显微观察鉴定等步骤。本发明从亚洲棉的根尖和叶片所解离的原生质体浓度较高(高于3000cells/μL)，且活率不低于92％，完全符合10×Genomics单细胞转录组测序的上机要求。因此本发明得出的根尖与叶片解离原生质体的方法，更好的解决了亚洲棉根尖细胞与叶肉细胞原生质体解离困难以及活率低的难题，从而可以更好的研究棉花抗逆过程特定基因的表达，对于棉花的遗传发育与培育抗逆棉花的品种至关重要。
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公开(公告)号：CN104212888A
公开(公告)日：2014-12-17
申请号：CN201410409161.6
申请日：2014-08-19
申请人： 中国农业科学院棉花研究所 , 安阳工学院 , 河北农业大学
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6841 , C12Q2543/10
摘要： 本发明属于分子细胞遗传学领域，具体涉及一种特异性标记棉花A genome和A sub-genome染色体端部的方法。用来源于海岛棉pima-90BAC文库的BAC克隆350B21，在不同棉种的有丝分裂中期染色体上进行BAC-FISH，发现在A genome和A sub-genome所有染色体的端部有较强烈杂交信号，而在D genome和D sub-genome所有染色体上杂交信号不明显。利用本发明的BAC克隆采用BAC-FISH方法，可快速有效标记棉花A genome和A sub-genome染色体端部。
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