-
公开(公告)号：CN109658978A
公开(公告)日：2019-04-19
申请号：CN201811595546.0
申请日：2018-12-25
申请人： 海南热带海洋学院
IPC分类号： G16B10/00 , C12Q1/6806
摘要： 本发明公开了一种基于COI基因序列片段的软珊瑚鉴定方法，涉及软珊瑚的鉴定领域，具体包括如下步骤：步骤一：潜入水下采集肉芝软珊瑚作为样品，并将样品保存于70％乙醇溶液中；步骤二：剪取不同样品组织10mg，用超纯水反复清洗几次，使用海洋动物组织基因组DNA提取试剂盒进行样品DNA提取：步骤三：对基因的序列进行分析：步骤四：通过步骤三中基因序列分析的结果对软珊瑚进行鉴定。在本发明的实施过程中，通过基因序列片段对肉芝软珊瑚进行鉴定，极大提高了软珊瑚的鉴定准确度，而且在肉芝软珊瑚的鉴定过程中所涉及到的设备均为实验室常用设备，常见易得，从而降低了肉芝软珊瑚的鉴定难度和鉴定成本。
-
公开(公告)号：CN109300501A
公开(公告)日：2019-02-01
申请号：CN201811100003.7
申请日：2018-09-20
申请人： 国家卫生计生委科学技术研究所
摘要： 本发明提供了一种蛋白质三维结构预测的方法，包括如下步骤：(1)检索与目标序列相关的结构；(2)选择模板；(3)将目标序列与模板结构对齐；(4)建立模型；(5)评估模型；(6)空间对齐处理。还提供了一种蛋白质三维结构预测云平台，包括：任务收集及检索模块、选择模板模块、目标序列与结构对齐模块、建模模块、评估模块和空间对齐模块，所述蛋白质三维结构预测云平台架设在云服务器上。还提供了该云平台的应用。
-
公开(公告)号：CN118369440A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202280063059.8
申请日：2022-09-02
申请人： 麦克诺玛公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6809 , C12Q1/6813 , C12Q1/6869 , G16B10/00 , C12Q1/6876
摘要： 本发明提供了用于鉴定癌症相关微生物特征的方法及其在诊断和治疗分层中的应用。
-
公开(公告)号：CN118366538A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202311280846.0
申请日：2023-09-28
申请人： 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
摘要： 本发明提供了一种基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法、系统及可存储介质，涉及生信分析领域。所述分型方法包括：获取待分析样本的测序数据，基于测序数据进行基因组组装，基因功能注释，得到基因集；对基因集进行筛选，得到核心基因集，筛选的标准包括：可变剪接被定义为不同的基因、同义突变被定义为相同的基因、旁系同源基因被排除、多拷贝基因被定义为相同的基因；通过软件进行等位基因调用，得到等位基因谱；计算待分析样本之间的相关性，得到分型结果。本发明公开的分型方法实现对真核生物核心基因组多位点序列的分型，分型结果可进行地理溯源和耐药性判断，具有重要的科研价值。
-
公开(公告)号：CN118335205A
公开(公告)日：2024-07-12
申请号：CN202410463165.6
申请日：2024-04-17
申请人： 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海华藤生物科技有限公司
摘要： 本发明提供了一种基于16S rRNA测序数据预测人体肠道健康状况的方法及其应用，包括：筛选代谢物小分子以及其主要生物途径中相关的酶；基于16SrRNA分析产生的OTU/ASV，构建包含参考基因组和环境采样生物的系统树，用于预测每个OTU/ASV的个体基因家族拷贝数；基于拷贝数预测采样序列的基因组含量；基于基因组含量预测酶活性相关基因家族的相对丰度谱，结合已知的功能注释数据库，预测每个样本中各个酶的相对丰度谱；酶的相对丰度谱反映了肠道内酶的活性，构建酶‑代谢物‑人体肠道微生态健康状况的生物网络，根据相关功能酶活性进行人体肠道微生态健康的评估/监控，以相关的酶活性变化反映人体肠道微生态健康状况。
-
公开(公告)号：CN118291450A
公开(公告)日：2024-07-05
申请号：CN202310519683.0
申请日：2023-05-10
申请人： 浙江农林大学
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , G16B30/10 , G16B10/00
摘要： 佯黄竹叶绿体基因组及其应用，属于基因技术领域。本发明首次公开了佯黄竹叶绿体基因组，以及其在品种鉴定和在重建簕竹属系统发育树中的应用，本发明将佯黄竹叶绿体基因组作为一个超级DNA条形码，用于鉴别竹子品种，为竹种质资源的保护、物种鉴定提供技术支撑，对于簕竹属植物的育种以及遗传多样性评价、保护与利用具有重要意义。
-
公开(公告)号：CN118255853A
公开(公告)日：2024-06-28
申请号：CN202410317709.8
申请日：2024-03-20
申请人： 湖北大学
IPC分类号： C07K14/39 , C12N15/31 , C12N15/81 , C12N1/19 , G16B5/00 , G16B10/00 , G16B20/00 , G16B30/10 , G16B30/00 , C12R1/865
摘要： 本发明涉及一种木糖转运蛋白基因Xt7及其蛋白构建方法和应用，本发明通过来自中间假丝酵母的Gxf1和树干毕赤酵母的Sut1作为靶点，利用祖先序列重建的方法去复活祖先木糖转运蛋白的氨基酸序列，得到祖先节点Xt7的氨基酸序列，经过密码子优化在酿酒酵母中异源表达，得到木糖转运蛋白基因Xt7，并表达得到有活性的功能蛋白，通过实验表明转运蛋白Xt7应用在酿酒酵母中时在木糖转运方面表现出优势，且Xt7在葡萄糖存在时转运木糖时表现出更少的受葡萄糖抑制的倾向，本发明首次通过祖先序列重建复活祖先的策略获得木糖转运蛋白，改进了酿酒酵母的木糖转运能力，为工业发酵工程提供了新的策略和方向。
-
公开(公告)号：CN118173164A
公开(公告)日：2024-06-11
申请号：CN202410016094.5
申请日：2024-01-04
IPC分类号： G16B20/00 , G16B30/00 , G16B10/00 , G16B40/20 , G06F40/242 , G06F40/284 , G06F18/2431 , G06N3/0455 , G06N3/08 , G06N7/02 , G05B13/02
摘要： 本发明公开了一种基于模糊控制优化的病毒宿主预测方法、系统及介质，病毒宿主预测方法包括：获取病毒全基因组数据，统计病毒全基因组数据中各密码子的出现频率，根据出现频率得到密码子字典；使用密码子字典替换预设的大语言模型中的文本文件，并根据病毒全基因组数据训练替换后的大语言模型，得到病毒宿主预测模型；获取待预测病毒的病毒序列，将病毒序列输入病毒宿主预测模型，得到最优潜在宿主；将最优潜在宿主输入预先设定好的模糊控制系统，得到最优潜在宿主对应的可靠程度，进而根据可靠程度确定待预测病毒的宿主并将其输出；其中，待预测病毒为真核RNA病毒。本发明能够精准的预测大范围的真核宿主，可广泛应用于宏病毒组数据处理领域。
-
公开(公告)号：CN118038964A
公开(公告)日：2024-05-14
申请号：CN202410246121.8
申请日：2024-03-05
申请人： 贵州医科大学
摘要： 本发明涉及致病菌药物筛选技术领域，具体涉及一种基于基因序列的智能抗菌药靶基因筛选方法。提取目标致病菌的待测基因；计算每个待测基因的蛋白适应性指数作为对应待测基因的必需性；对每个待测基因利用BAST方法进行比对，根据比对结果与设定的蛋白序列长度阈值确定每个待测基因的宿主毒性；获取每个待测基因被Drugbank数据库收录的比例作为每个待测基因的成药性；基于每个待测基因的必需性、宿主毒性以及成药性建立靶基因筛选模型；根据所述靶基因筛选模型对目标致病菌的每个待测基因进行靶标筛选。本发明建立的筛选模型同时考虑三个指标进行靶标筛选，能够对每个筛选出的靶标基因进行有效评估，且算法使用起来更加便捷，可靠性较高。
-
公开(公告)号：CN117912541A
公开(公告)日：2024-04-19
申请号：CN202311695435.8
申请日：2023-12-11
申请人： 华智生物技术有限公司
摘要： 本申请提供了一种多物种育种分析方法、设备及计算机可读介质，所述方法包括：获取用户上传的待分析物种育种数据；从数据库中获取与所述育种数据相匹配的算法和参数；根据所述算法和参数对所述待分析物种做育种分析；展示并存储分析结果。该申请通过建设物种育种分析平台，用户选择物种类型并上传待分析的物种育种数据，平台通过数据库获取相匹配的算法和方法，对数据进行分析并给出育种决策和建议，可以为用户提供精准、高效的分析结果和育种决策，还便于用户快速获取不同物种的育种建议。
-
-
-
-
-
-
-
-
-
搜索结果
175 条记录 (耗时 0.019 秒)
