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公开(公告)号:CN106156540A
公开(公告)日:2016-11-23
申请号:CN201510140851.0
申请日:2015-03-27
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种分析个体两类状态的免疫差异的方法,包括步骤:获取第一测序数据和第二测序数据;分别对第一测序数据中的第一读段和第二测序数据中的第二读段进行拼接,获得第一拼接序列和第二拼接序列;将第一拼接序列和第二拼接序列分别与多种CDR3参考序列比对,获得第一CDR3序列和第二CDR3序列;比较第一CDR3序列和第二CDR3序列中的各种VJ组合亚型的使用频率的差异,确定差异具有统计意义的VJ组合亚型对第一类状态和第二类状态的区分效果。本发明还公开一种辅助确定个体状态的方法和/或装置。
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公开(公告)号:CN105803054A
公开(公告)日:2016-07-27
申请号:CN201410852105.X
申请日:2014-12-31
Applicant: 天津华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种试剂盒,其包含探针,所述探针能够特异性识别表1~23中的至少一个表所示的区域。本发明还公开该试剂盒在检测唇腭裂相关基因中的用途、检测唇腭裂相关基因的方法和装置。利用本发明的试剂盒能够高效、快捷、经济的同时检测多个唇腭裂相关基因的变异情况。
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公开(公告)号:CN104293940A
公开(公告)日:2015-01-21
申请号:CN201410521540.4
申请日:2014-09-30
Applicant: 天津华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因科技有限公司
CPC classification number: C12N15/1082 , C12Q1/6869 , C12Q2537/165
Abstract: 公开了构建测序文库的方法及其应用,该方法包括:(a)在双链DNA片段的两端分别连接接头,以便获得连接产物;(b)将所述连接产物裂解为单链DNA片段;(c)利用探针对所述单链DNA片段进行筛选;(d)利用第一引物对所述单链DNA片段进行链延伸反应,以便获得链延伸产物;(e)对所述链延伸产物进行扩增,以便获得扩增产物,所述扩增产物构成所述测序文库。还公开了测序方法、确定核酸序列的方法、构建测序文库的装置、测序设备以及确定核酸序列的系统。
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公开(公告)号:CN104293938A
公开(公告)日:2015-01-21
申请号:CN201410519403.7
申请日:2014-09-30
Applicant: 天津华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因科技有限公司
CPC classification number: C12N15/1093 , C12Q1/6869 , G06F19/22 , C12Q2535/122
Abstract: 公开了构建测序文库的方法及其应用,该方法包括:(a)在双链DNA片段的两端分别连接接头,以便获得连接产物;(b)将所述连接产物裂解为单链DNA片段;(c)利用探针对所述单链DNA片段进行筛选;(d)利用第一引物对所述单链DNA片段进行链延伸反应,以便获得链延伸产物;(e)对所述链延伸产物进行扩增,以便获得扩增产物,所述扩增产物构成所述测序文库。还公开了测序方法、确定核酸序列的方法、构建测序文库的装置、测序设备以及确定核酸序列的系统。
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公开(公告)号:CN101921874A
公开(公告)日:2010-12-22
申请号:CN201010213722.7
申请日:2010-06-30
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
CPC classification number: C12Q1/708 , C12Q1/6874
Abstract: 本发明涉及人类乳头瘤病毒(Human Papilloma Virus,HPV)的检测方法,特别是基于Solexa测序法的HPV检测方法。
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公开(公告)号:CN106480170B
公开(公告)日:2019-10-22
申请号:CN201510551315.X
申请日:2015-08-31
Applicant: 广州华大基因医学检验所有限公司 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC: G16B30/10 , C12Q1/6858 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种确定供体和受体差异SNP的方法,包括:获得第一和第二测序数据;分别将第一和第二测序数据与参考序列比对,获得第一和第二比对结果;分别基于第一和第二比对结果进行SNP检测,获得第一和第二分型结果;比较第一和第二分型结果,确定差异SNP。还公开一种确定受体中供体来源cfDNA比例的方法、一种监测器官移植排斥的方法及装置。本发明的方法和/或装置能够确定供体和受体的差异SNP、准确确定受体中供体来源cfDNA的比例,能够作为器官移植排斥监测的辅助或补充手段。
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公开(公告)号:CN105648045B
公开(公告)日:2019-10-11
申请号:CN201410639577.7
申请日:2014-11-13
Applicant: 天津华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , G16B30/00 , C12M1/34
Abstract: 本发明提供了一种确定胎儿目标区域单体型的方法及其装置。确定胎儿目标区域单体型的方法包括:对孕妇体液中游离核酸的目标区域进行序列测定,以便获得第一测序数据;对胎儿家系成员的相同目标区域进行序列测定,以便获得第二测序数据、第三测序数据和第四测序数据,其中,第二测序数据为胎儿母亲的测序数据,第三测序数据为胎儿父亲的测序数据,第四测序数据为先证者的测序数据;基于第一、第二以及任选的第三测序数据,确定述孕妇体液中的胎儿核酸含量;基于第二、第三和第四测序数据,分别构建胎儿母亲的目标区域单体型和胎儿父亲的目标区域单体型;以及基于胎儿母亲、父亲的目标区域单体型以及胎儿核酸含量,确定胎儿的目标区域单体型。
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公开(公告)号:CN105780129B
公开(公告)日:2019-06-11
申请号:CN201410779502.9
申请日:2014-12-15
Applicant: 天津华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供一种构建目标区域测序文库的方法,包括:获取待测样本中的核酸,所述核酸由多个核酸片段组成;末端修复所述核酸片段,获得末端修复片段;加碱基A至所述末端修复片段的两端,获得粘性末端片段;连接接头于所述粘性末端片段的两端,获得接头连接片段;对所述接头连接片段进行第一扩增,获得第一扩增产物;利用试剂盒对所述第一扩增产物进行捕获,获得所述目标区域;以及对所述目标区域进行第二扩增,获得第二扩增产物,所述第二扩增产物即为所述目标区域测序文库;其中,所述试剂盒包含探针,所述探针能够特异性识别表1里的547个基因中的至少10个基因的基因区域。本发明还公开了一种测序方法、目标区域变异检测方法及其装置。
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公开(公告)号:CN104294371B
公开(公告)日:2017-07-04
申请号:CN201410520223.0
申请日:2014-09-30
Applicant: 天津华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 公开了构建测序文库的方法及其应用,该方法包括:(a)在双链DNA片段的两端分别连接接头,以便获得连接产物;(b)将所述连接产物裂解为单链DNA片段;(c)利用探针对所述单链DNA片段进行筛选;(d)利用第一引物对所述单链DNA片段进行链延伸反应,以便获得链延伸产物;(e)对所述链延伸产物进行扩增,以便获得扩增产物,所述扩增产物构成所述测序文库。还公开了测序方法、确定核酸序列的方法、构建测序文库的装置、测序设备以及确定核酸序列的系统。
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公开(公告)号:CN106156541A
公开(公告)日:2016-11-23
申请号:CN201510140864.8
申请日:2015-03-27
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种分析个体两类状态的免疫差异的方法,包括步骤:获取第一测序数据和第二测序数据;分别对第一测序数据中的第一读段和第二测序数据中的第二读段进行拼接,获得第一拼接序列和第二拼接序列;将第一拼接序列和第二拼接序列分别与多种CDR3参考序列比对,获得第一CDR3序列和第二CDR3序列;比较第一高频CDR3序列比例和第二高频CDR3序列比例的差异,确定差异具有统计意义的高频CDR3序列比例对第一类状态和第二类状态的区分效果。本发明还公开一种辅助确定个体状态的方法和/或装置。
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