玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPII)基因位点及应用

    公开(公告)号:CN102978203B

    公开(公告)日:2016-02-03

    申请号:CN201210444717.6

    申请日:2012-11-09

    IPC分类号: C12N15/11 C12Q1/68

    摘要: 本发明涉及与玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPII)基因位点及应用,属于分子育种领域。本发明的玉米油份相关的位点为玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)位于chr8.S_38521846的SNP位点,该位点突变为G/T;以及位于玉米衣被蛋白复合体COPII基因(GRMZM2G003022)5’UTR区域InDel_20位点。可将分子标记用于玉米品种或品系的基因型检测,以判断该品种或品系油份含量的大小。本发明采用分子标记辅助选择不仅准确性高,加快选择进度,提高了育种效率。

    一种玉米油份含量相关的SNP位点及其应用

    公开(公告)号:CN102994496A

    公开(公告)日:2013-03-27

    申请号:CN201210444673.7

    申请日:2012-11-09

    IPC分类号: C12N15/11 C12Q1/68 A01H1/04

    摘要: 本发明涉及一种玉米油份含量相关的SNP位点及其应用,属于植物分子育种领域。玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)位于chr3.S_166664152的SNP与玉米三酰甘油酯酶(TAGL)基因紧密连锁,并且与玉米油份含量显著相关。本发明的位点可用于高油玉米分子标记辅助育种,克服了常规育种周期长、后期筛选工作量大、对品种或品系进行鉴定的效率低等缺陷和不足。

    一种玉米油份含量相关基因的分子标记的应用

    公开(公告)号:CN102925457A

    公开(公告)日:2013-02-13

    申请号:CN201210444716.1

    申请日:2012-11-09

    摘要: 本发明涉及一种玉米油份含量相关的分子标记及其应用,属于植物分子育种领域。本发明的玉米油份相关的位点为玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)位于chr1.S_248149904的SNP位点,该位点突变为T/C;以及位于玉米ACP基因(GRMZM2G110298)3’UTR处的InDel_8位点。可将分子标记用于玉米品种或品系的基因型检测,以判断该品种或品系油份含量的大小。本发明采用分子标记辅助选择不仅准确性高,加快选择进度,同时也将大大减少了育种的工作量,提高了育种效率。

    一种用于整合多类型数据进行表型预测的多视图GBLUP方法

    公开(公告)号:CN117153247A

    公开(公告)日:2023-12-01

    申请号:CN202310986747.8

    申请日:2023-08-04

    摘要: 本发明公开了一种用于整合多类型数据进行表型预测的多视图GBLUP方法,包括以下步骤:将SNP基因型数据按照不同的表型类型表示为0/1/2形式的多类型数据,对数据进行Z‑score标准化;设多类型数据矩阵中的第i行和第j行为个体xi,xj,计算Kinship矩阵,定义两个个体间的相似性函数;将多类型数据加权整合成一个Kinship矩阵,使用差分进化算法,对种群进行变异、交叉操作,对比种群中的个体和经过变异、交叉后的个体,将权重赋予多类型数据的Kinship矩阵,将其代入到GBLUP模型中学习,选择表型预测精度高的个体作为下一代种群的成员;设置终止条件,输出多类型数据最优的权重组合。本发明能够快速准确的获取多类型数据的最优权重组合,辅助表型预测。

    改良玉米果穗形态的方法
    56.
    发明授权

    公开(公告)号:CN114891826B

    公开(公告)日:2023-10-27

    申请号:CN202210337659.0

    申请日:2022-04-01

    发明人: 刘喻 罗芸 严建兵

    摘要: 本发明涉及玉米基因ZmTPK1在改良玉米果穗形态中的应用,属于分子遗传学领域。本发明公开了玉米果穗形态基因ZmTPK1,其特征在于所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2‑SEQ ID NO.3任意一个所示;所编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。进一步地,本发明提供了改良玉米果穗形态的方法,该方法可用于提高鲜食玉米品质。

    基于高光谱成像的作物籽粒代谢性状检测和遗传解析方法

    公开(公告)号:CN113393897B

    公开(公告)日:2022-04-12

    申请号:CN202110707252.8

    申请日:2021-06-22

    IPC分类号: G16B20/20

    摘要: 本发明公开了一种基于高光谱成像的作物籽粒代谢性状检测和遗传解析方法。首先利用高光谱相机采集作物籽粒的高光谱图像,得到上千种作物籽粒高光谱指数,其次利用气相/高效液相色谱‑串联质谱法检测上千种代谢物;基于群体各株系的基因分型信息,分别以高光谱指数和代谢物含量作为作物籽粒表型性状进行全基因组关联分析,筛选显著SNP位点,对两组显著SNP位点进行共定位分析,构建高光谱表型‑基因型‑代谢表型关联网络H1‑G‑M1;对高光谱指数和代谢物含量使用Lasso回归进行特征筛选,构建高光谱‑代谢表型关联网络H2‑M2;综合分析H1‑G‑M1和H2‑M2网络,整合二者构建高光谱表型‑基因型‑代谢物表型关联网络H3‑G‑M3,进一步挖掘作物籽粒代谢遗传结构的新信息。