一种多重甲基化特异性PCR引物设计方法及系统

    公开(公告)号:CN111653311B

    公开(公告)日:2023-05-12

    申请号:CN202010479453.2

    申请日:2020-05-29

    发明人: 易吉 李泽卿

    IPC分类号: G16B20/00

    摘要: 本发明公开了一种多重甲基化特异性PCR引物设计方法及系统,本发明实施步骤包括根据用户需求设置参数,对目标甲基化位点进行引物设计及筛选,然后对筛选出的多个甲基化位点引物对两两进行配对并检查兼容性,选择数量最大的可兼容的多重引物组合,最后对设计完成的多重引物组合进行评价,并决定是否需要重新设计引物。本发明能实现超长长度序列的多重甲基化特异性PCR引物设计,能有效减少单对引物内部之间和多对引物之间dimer/hairpin等二级结构的出现以及在基因组中的非特异性扩增,设计出的引物特异性强,提高了多重甲基化特异性PCR实验测试过程的可操作性和准确度,同时大大提高了工作效率。

    肺癌血浆游离DNA甲基化检测用的多重PCR引物系统、检测方法及应用

    公开(公告)号:CN111676286B

    公开(公告)日:2023-04-14

    申请号:CN202010479463.6

    申请日:2020-05-29

    摘要: 本发明公开了一种肺癌血浆游离DNA甲基化检测用的多重PCR引物系统、检测方法及应用。该肺癌血浆游离DNA甲基化检测用的多重PCR系统包括第一轮多重PCR引物组和/或第二轮多重PCR引物,其中,第一轮多重PCR引物组包含55对PCR引物对,序列分别如序列表中SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.110所示,第二轮多重PCR引物的序列如SEQ ID NO.111~SEQ ID NO.112所示。本发明提供的肺癌血浆游离DNA甲基化检测方法能一次性同时对肺癌相关的55个甲基化位点进行检测,多重PCR引物之间相互干扰小,特异性强,扩增效率高,并且减少样本损耗,降低检测成本,提高检测效率,配合高通量测序技术,可明显提高早期肺癌的检出率,适于推广应用。

    液滴生成方法、系统及其应用

    公开(公告)号:CN114377738B

    公开(公告)日:2022-08-26

    申请号:CN202111335113.3

    申请日:2021-11-11

    发明人: 李昂 彭德镇 周阳

    IPC分类号: B01L3/02

    摘要: 本发明涉及一种液滴生成方法、系统及其应用,该方法包括:S1、将第二液体移送至所述液滴生成管中,第二液体为与第一液体不混溶的液体;S2、将液滴生成管插入到第一液体中,使液滴生成管的第二端口位于第一液体的液面之下;S3、控制容纳腔使其容积发生周期性变化,以及向流体通路内注入驱动流体以驱动第二液体运动。本发明提供了全新的液滴生成方法,突破现有纳升量级液滴生成技术必须采用0.1毫米以下微管道的限制,用显著降低的成本即可实现小体积均一液滴的制备。

    液滴生成方法及装置
    4.
    发明公开

    公开(公告)号:CN114752479A

    公开(公告)日:2022-07-15

    申请号:CN202110037952.0

    申请日:2021-01-12

    IPC分类号: C12M1/34 C12M1/00 C12Q1/6851

    摘要: 本发明涉及一种新型液滴生成方法及装置,通过简单的第一腔体、第二腔体和孔结构可实现稳定的两种互不相溶液体的共流喷射,同时通过对第一腔体、第二腔体进行往复振动使得内层液体喷射可以稳定的破裂为均匀的微滴,整个生成过程无需微米量级的微流道结构,且可以通过控制振动幅度、频率和推动液体流动的速率来调整微滴的生成体积和生成速率,而且通量高。同时,本发明的装置结构简单,零部件少,产业上易于制造;本发明的方法对于生化样品而言,也可以稳定获得均一大小的液滴,液滴体积和生成速率可自由调节,并且不容易受到外力干扰的影响,产业上容易实施。

    液滴生成方法、系统及其应用

    公开(公告)号:CN114377738A

    公开(公告)日:2022-04-22

    申请号:CN202111335113.3

    申请日:2021-11-11

    发明人: 李昂 彭德镇 周阳

    IPC分类号: B01L3/02

    摘要: 本发明涉及一种液滴生成方法、系统及其应用,该方法包括:S1、将第二液体移送至所述液滴生成管中,第二液体为与第一液体不混溶的液体;S2、将液滴生成管插入到第一液体中,使液滴生成管的第二端口位于第一液体的液面之下;S3、控制容纳腔使其容积发生周期性变化,以及向流体通路内注入驱动流体以驱动第二液体运动。本发明提供了全新的液滴生成方法,突破现有纳升量级液滴生成技术必须采用0.1毫米以下微管道的限制,用显著降低的成本即可实现小体积均一液滴的制备。

    一种猪脂肪组织的超声破碎方法及其应用

    公开(公告)号:CN108949742B

    公开(公告)日:2022-03-15

    申请号:CN201810935599.6

    申请日:2018-08-16

    发明人: 李泽卿 王亮

    摘要: 本发明属于染色质免疫共沉淀领域,具体涉及一种猪脂肪组织的超声破碎方法及其应用,包括(1)猪脂肪组织进行冰上甲醛交联反应、(2)甘氨酸冰上终止交联后离心并冰浴分层、(3)获取猪脂肪组织细胞沉淀层、(4)获取细胞核沉淀层、(5)超声打断染色质获得蛋白核酸复合物的小片段五个步骤。本发明的猪脂肪组织的超声破碎方法整个实验操作均保持低温条件,更大程度保证了蛋白的天然结构,从而得到真实抗体吸附的DNA‑蛋白复合物。且得到的蛋白核酸复合物的小片段可直接用于后续ChIP,得到的DNA检测其浓度并用高通量测序检测全基因组范围内的DNA和目的蛋白的结合情况。并进一步用富集后得到的dna建库后二代测序,应用于猪脂肪组织DNA生物信息学分析。

    肺癌血浆游离DNA甲基化检测用的多重PCR引物系统、检测方法及应用

    公开(公告)号:CN111676286A

    公开(公告)日:2020-09-18

    申请号:CN202010479463.6

    申请日:2020-05-29

    摘要: 本发明公开了一种肺癌血浆游离DNA甲基化检测用的多重PCR引物系统、检测方法及应用。该肺癌血浆游离DNA甲基化检测用的多重PCR系统包括第一轮多重PCR引物组和/或第二轮多重PCR引物,其中,第一轮多重PCR引物组包含55对PCR引物对,序列分别如序列表中SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.110所示,第二轮多重PCR引物的序列如SEQ ID NO.111~SEQ ID NO.112所示。本发明提供的肺癌血浆游离DNA甲基化检测方法能一次性同时对肺癌相关的55个甲基化位点进行检测,多重PCR引物之间相互干扰小,特异性强,扩增效率高,并且减少样本损耗,降低检测成本,提高检测效率,配合高通量测序技术,可明显提高早期肺癌的检出率,适于推广应用。

    一种多重甲基化特异性PCR引物设计方法及系统

    公开(公告)号:CN111653311A

    公开(公告)日:2020-09-11

    申请号:CN202010479453.2

    申请日:2020-05-29

    发明人: 易吉 李泽卿

    IPC分类号: G16B20/00

    摘要: 本发明公开了一种多重甲基化特异性PCR引物设计方法及系统,本发明实施步骤包括根据用户需求设置参数,对目标甲基化位点进行引物设计及筛选,然后对筛选出的多个甲基化位点引物对两两进行配对并检查兼容性,选择数量最大的可兼容的多重引物组合,最后对设计完成的多重引物组合进行评价,并决定是否需要重新设计引物。本发明能实现超长长度序列的多重甲基化特异性PCR引物设计,能有效减少单对引物内部之间和多对引物之间dimer/hairpin等二级结构的出现以及在基因组中的非特异性扩增,设计出的引物特异性强,提高了多重甲基化特异性PCR实验测试过程的可操作性和准确度,同时大大提高了工作效率。

    一种猪脂肪组织的超声破碎方法及其应用

    公开(公告)号:CN108949742A

    公开(公告)日:2018-12-07

    申请号:CN201810935599.6

    申请日:2018-08-16

    发明人: 李泽卿 王亮

    摘要: 本发明属于染色质免疫共沉淀领域,具体涉及一种猪脂肪组织的超声破碎方法及其应用,包括(1)猪脂肪组织进行冰上甲醛交联反应、(2)甘氨酸冰上终止交联后离心并冰浴分层、(3)获取猪脂肪组织细胞沉淀层、(4)获取细胞核沉淀层、(5)超声打断染色质获得蛋白核酸复合物的小片段五个步骤。本发明的猪脂肪组织的超声破碎方法整个实验操作均保持低温条件,更大程度保证了蛋白的天然结构,从而得到真实抗体吸附的DNA‑蛋白复合物。且得到的蛋白核酸复合物的小片段可直接用于后续ChIP,得到的DNA检测其浓度并用高通量测序检测全基因组范围内的DNA和目的蛋白的结合情况。并进一步用富集后得到的dna建库后二代测序,应用于猪脂肪组织DNA生物信息学分析。