一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的活性检测方法及其应用

    公开(公告)号:CN104316682A

    公开(公告)日:2015-01-28

    申请号:CN201410530672.3

    申请日:2014-10-10

    申请人: 三峡大学

    IPC分类号: G01N33/573 G01N21/33

    CPC分类号: G01N33/573 G01N21/33

    摘要: 一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的活性检测方法,括如下步骤:将二氧化碳测定试剂R1混合试剂、R2混合试剂在1.5mL的EP试管进行混合,再添加腺苷甲硫氨酸,最后添加S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(AdoMetDC),得到总体积为1000ul的混合液,启动反应;将上述混合液在37℃的水浴中孵育反应1-30min后,再将该混合液转至200uL/孔的透明96孔板,利用酶标仪等仪器检测体系在340nm波长处的光吸收,对该混合物的反应活性进行检测。该方法操作简单,效果良好,只需要简单的光吸收检测,即可实现。该方法适用于快速进行AdoMetDC活性的检测和抑制剂的筛选与设计。

    一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(AdoMetDC)上的应用

    公开(公告)号:CN104324027B

    公开(公告)日:2016-07-06

    申请号:CN201410534409.1

    申请日:2014-10-10

    申请人: 三峡大学

    摘要: 本发明提供一种小分子抑制剂,其结构式为:其中R1为氢、氨基、甲基或乙基;R2为氨基、羧基、甲酰胺基或乙酰胺基;R3为羧基、磺酸基、硝基、亚硝基或偶氮;该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐。利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。并将上述小分子抑制剂应用于抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶活性上。

    一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋及其应用

    公开(公告)号:CN104357545B

    公开(公告)日:2016-06-01

    申请号:CN201410530674.2

    申请日:2014-10-10

    申请人: 三峡大学

    发明人: 刘森 廖陈曾

    IPC分类号: C12Q1/527

    摘要: 本发明提供一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋,其特征在于:以S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(AdoMetDC)的晶体结构为基础,将PDB ID为3DZ5的AdoMetDC晶体结构中的第68位丙酮酰基用PDB ID 1JL0的AdoMetDC晶体结构中的第68位色氨酸残基替代,以替代后的AdoMetDC晶体结构为基础,通过Pocket蛋白质药物口袋分析软件,确定在alpha亚基和beta亚基两条链之间形成的药物口袋为S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋,并将该药物口袋应用于AdoMetDC抑制剂的筛选、设计和改造。

    一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的活性检测方法及其应用

    公开(公告)号:CN104316682B

    公开(公告)日:2015-12-30

    申请号:CN201410530672.3

    申请日:2014-10-10

    申请人: 三峡大学

    IPC分类号: C12Q1/32

    摘要: 一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的活性检测方法,括如下步骤:将二氧化碳测定试剂R1混合试剂、R2混合试剂在1.5mL的EP试管进行混合,再添加腺苷甲硫氨酸,最后添加S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(AdoMetDC),得到总体积为1000ul的混合液,启动反应;将上述混合液在37℃的水浴中孵育反应1-30min后,再将该混合液转至200uL/孔的透明96孔板,利用酶标仪等仪器检测体系在340nm波长处的光吸收,对该混合物的反应活性进行检测。该方法操作简单,效果良好,只需要简单的光吸收检测,即可实现。该方法适用于快速进行AdoMetDC活性的检测和抑制剂的筛选与设计。

    一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用

    公开(公告)号:CN104784183B

    公开(公告)日:2016-09-07

    申请号:CN201510057907.6

    申请日:2015-02-04

    申请人: 三峡大学

    IPC分类号: A61K31/519 A61P35/00

    摘要: 一种小分子抑制剂,该小分子抑制剂的结构式为该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐,其中,R2包括=O,‑NH2,‑CH2(NH2),‑C(NH2)3,‑CO(NH2),‑CH2‑CHO中的任意一种。本发明将该小分子抑制剂在抑制S‑腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用。本发明利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于‑7.0的小分子用于实验验证。

    一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(AdoMetDC)上的应用

    公开(公告)号:CN104324027A

    公开(公告)日:2015-02-04

    申请号:CN201410534409.1

    申请日:2014-10-10

    申请人: 三峡大学

    CPC分类号: A61K31/4196 C07D409/12

    摘要: 本发明提供一种小分子抑制剂,其结构式为:其中R1为氢、氨基、甲基或乙基;R2为氨基、羧基、甲酰胺基或乙酰胺基;R3为羧基、磺酸基、硝基、亚硝基或偶氮;该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐。利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。并将上述小分子抑制剂应用于抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶活性上。

    一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用

    公开(公告)号:CN104324031B

    公开(公告)日:2017-01-11

    申请号:CN201410534410.4

    申请日:2014-10-10

    申请人: 三峡大学

    摘要: 本发明提供一种小分子抑制剂,其结构式为: 所述的R1为氢、甲基、乙基、硝基、亚硝基、磺酸基、羧基、氨基或偶氮;R2为氢、甲基、乙基、硝基、亚硝基、磺酸基、羧基、氨基或偶氮;X为氢、氟、氯、溴或碘;该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐。利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。并将上述小分子抑制剂应用于抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶活性上。

    小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用

    公开(公告)号:CN104367573B

    公开(公告)日:2016-06-01

    申请号:CN201410532418.7

    申请日:2014-10-10

    申请人: 三峡大学

    摘要: 本发明提供一种小分子抑制剂,其结构式为:所述的R1为亚氨基、羰基、呋喃或噻吩;R2为氢、羟基、甲基、乙基、苯基或苄基;R3为氢、硝基、氨基或羟基;该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐。利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。并将上述小分子抑制剂应用于抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶活性上。

    一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用

    公开(公告)号:CN104784183A

    公开(公告)日:2015-07-22

    申请号:CN201510057907.6

    申请日:2015-02-04

    申请人: 三峡大学

    IPC分类号: A61K31/519 A61P35/00

    摘要: 一种小分子抑制剂,该小分子抑制剂的结构式为该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐,其中,R2包括=O,-NH2,-CH2(NH2),-C(NH2)3,-CO(NH2),-CH2-CHO中的任意一种。本发明将该小分子抑制剂在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用。本发明利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。