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公开(公告)号：CN111223523B
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202010013036.9
申请日：2020-01-06
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于多时滞因果熵的基因调控网络构建方法及系统，对输入的时间序列基因表达数据划分成不同时滞下的时间窗口；对t个时间片的基因表达数据，分别构建t‑τ个时间窗口下的基因表达矩阵，对每一对基因，计算t时间窗口下的目标基因与之前t‑τ个时间窗口下基因的多时滞转移熵，得到一个多时滞下的基因相关性矩阵，矩阵的元素代表基因之间存在边的概率，并对矩阵通过k‑means将边聚类分成两类，过滤掉低概率的边簇，对剩下的每条边计算在条件基因下的多时滞条件转移熵，对最大因果熵小于阈值的间接调控的边过滤掉，获得最终的网络结构。本发明有效提高了推断的准确性。
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公开(公告)号：CN111223523A
公开(公告)日：2020-06-02
申请号：CN202010013036.9
申请日：2020-01-06
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于多时滞因果熵的基因调控网络构建方法及系统，对输入的时间序列基因表达数据划分成不同时滞下的时间窗口；对t个时间片的基因表达数据，分别构建t-τ个时间窗口下的基因表达矩阵，对每一对基因，计算t时间窗口下的目标基因与之前t-τ个时间窗口下基因的多时滞转移熵，得到一个多时滞下的基因相关性矩阵，矩阵的元素代表基因之间存在边的概率，并对矩阵通过k-means将边聚类分成两类，过滤掉低概率的边簇，对剩下的每条边计算在条件基因下的多时滞条件转移熵，对最大因果熵小于阈值的间接调控的边过滤掉，获得最终的网络结构。本发明有效提高了推断的准确性。
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