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公开(公告)号:CN118497352B
公开(公告)日:2024-12-13
申请号:CN202410364185.8
申请日:2024-03-28
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地 , 中国水产科学研究院南海水产研究所 , 三亚热带水产研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种卵形鲳鲹全基因组选育的SNP分子标记组合,所述SNP分子标记组合包括40475个SNP位点中的任意组合,所述40475个SNP位点的信息具体如表1所示,本发明还公开了基于所述SNP分子标记组合的卵形鲳鲹全基因组液相芯片和试剂盒,所述SNP分子标记组合、试剂盒或SNP液相芯片可以用在卵形鲳鲹全基因组关联分析、卵形鲳鲹基因分型、卵形鲳鲹育种或辅助育种、检测卵形鲳鲹DNA样品中,本发明开发专门针对卵形鲳鲹的SNP芯片,对于提高种质资源的利用效率、加快优良性状的选育进程、提升养殖品种的经济价值和环境适应性具有重要意义。
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公开(公告)号:CN118497352A
公开(公告)日:2024-08-16
申请号:CN202410364185.8
申请日:2024-03-28
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地 , 中国水产科学研究院南海水产研究所 , 三亚热带水产研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种卵形鲳鲹全基因组选育的SNP分子标记组合,所述SNP分子标记组合包括40475个SNP位点中的任意组合,所述40475个SNP位点的信息具体如表1所示,本发明还公开了基于所述SNP分子标记组合的卵形鲳鲹全基因组液相芯片和试剂盒,所述SNP分子标记组合、试剂盒或SNP液相芯片可以用在卵形鲳鲹全基因组关联分析、卵形鲳鲹基因分型、卵形鲳鲹育种或辅助育种、检测卵形鲳鲹DNA样品中,本发明开发专门针对卵形鲳鲹的SNP芯片,对于提高种质资源的利用效率、加快优良性状的选育进程、提升养殖品种的经济价值和环境适应性具有重要意义。
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公开(公告)号:CN118562969A
公开(公告)日:2024-08-30
申请号:CN202410746328.1
申请日:2024-06-11
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , G16B20/20 , G16B30/10 , G16B50/10 , G16B40/10
Abstract: 本发明公开了一种卵形鲳鲹脂肪酸性状相关基因的筛选方法,该方法基于核苷酸多样性(π)和遗传分化指数(Fst)的选择信号分析策略共同鉴定出与卵形鲳鲹脂肪酸性状相关的候选基因,本发明采用全基因组选择性扫描分析研究了卵形鲳鲹鱼脂肪酸性状的遗传基础,筛选到了与卵形鲳鲹鱼脂肪酸性状相关的候选基因,这些功能基因的定位对加速卵形鲳鲹新品种育种进程、提高育种效率具有重要意义。
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公开(公告)号:CN116555433B
公开(公告)日:2024-03-19
申请号:CN202211695111.X
申请日:2022-12-28
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的引物,所述引物为引物1或引物2,所述引物1包括正向引物1F和反向引物1R,所述正向引物1F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述反向引物1R的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;所述引物2包括正向引物2F和反向引物2R,所述正向引物2F的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述反向引物2R的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。本发明还公开了一种鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的试剂盒和方法,以及上述引物、试剂盒和方法在鉴别黄鳍棘鲷和平鲷中的应用。
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公开(公告)号:CN115927662B
公开(公告)日:2024-01-05
申请号:CN202211171718.8
申请日:2022-09-26
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种二长棘犁齿鲷SNP位点标记组合的扩增引物,所述二长棘犁齿鲷SNP位点标记组合的扩增引物为25对,其核苷酸序列依次如SEQ IDNO:1~50所示,用于扩增的二长棘犁齿鲷SNP位点标记组合为50个,编号分别为ECSNP1~ECSNP50,分别位于如SEQ ID NO:51~75所示的序列中。还公开了上述引物在二长棘犁齿鲷遗传多样性分析中的应用。本发明首次在二长棘犁齿鲷上批量建立了具有丰富多态性的SNP分子标记,筛选出了25对多态性引物,为二长棘犁齿鲷的家系鉴定、种群遗传结构、遗传育种,增殖放流等研究提供了高效的分析技术工具。
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公开(公告)号:CN115595297B
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202211169749.X
申请日:2022-09-22
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所
Abstract: 本发明公开了一种卵形鲳鲹肌肉细胞系,该细胞系的保藏号为CCTCC NO:C2022275,该细胞系细胞增殖速度快,可以连续传代并保持稳定。本发明公开了的该细胞系构建方法。本发明还公开了所述卵形鲳鲹肌肉细胞系在鱼类病毒免疫检测中的应用,以及在表达外源基因中的应用。
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公开(公告)号:CN115820868B
公开(公告)日:2023-08-29
申请号:CN202210895927.0
申请日:2022-07-27
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6809 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于扩增黑棘鲷SNP分子标记的多态性引物,所述引物为引物对1‑引物对29,每对引物均包括上游引物和下游引物,所述引物对1‑引物对29的碱基序列依次如SEQ ID NO:1~58所示。还公开了引物在黑棘鲷遗传多样性分析中的应用以及上述SNP分子标记和引物的筛选方法。本发明首次在黑棘鲷上批量建立了具有丰富多态性的48个SNP分析标记,并筛选出了29对多态性引物,为黑棘鲷的家系鉴定、种群遗传结构、遗传育种,增殖放流等研究提供了高效的分析技术工具;本发明提供的黑棘鲷SNP分子标记及其多态性引物的筛选方法,简便、快捷、高效,节约了人力和成本。
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公开(公告)号:CN116083591A
公开(公告)日:2023-05-09
申请号:CN202211095953.1
申请日:2022-09-08
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12Q1/6811
Abstract: 本发明公开了一种平鲷SNP分子标记的多态性引物,所述多态性引物为18对,18对引物的核苷酸序列依次如SEQ ID NO:1~36所示,18对引物用于扩增的平鲷SNP分子标记为36个,编号依次为RSSNP1~RSSNP36,所述RSSNP1~RSSNP36位于如SEQ ID NO:37~54所示的序列中,还公开了上述引物在平鲷遗传多样性分析中的应用。本发明首次在平鲷上批量建立了具有丰富多态性的SNP分子标记,并筛选出了18对多态性引物,为平鲷的家系鉴定、种群遗传结构、遗传育种,增殖放流等研究提供了高效的分析技术工具;本发明所使用的开发SNP标记的方法,简便、快捷、高效,节约了人力和成本。
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公开(公告)号:CN113684285B
公开(公告)日:2022-05-10
申请号:CN202111131036.X
申请日:2021-09-26
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了卵形鲳鲹刺激隐核虫病关联的SNP分子标记,所述SNP分子标记位于RAC3基因组如SEQ ID NO:1所示的碱基序列自5’端起的第4116位,其碱基分别为G或T,还公开了用于扩增SNP分子标记的引物,以及上述SNP分子标记或引物在鉴别或选育不易感刺激隐核虫病卵形鲳鲹品种方面的应用。本发明通过检测卵形鲳鲹SNP4116位点基因型,就能够有效地明确该个体是否易感染刺激隐核虫病,在早期候选亲本中淘汰掉TG基因型个体有利于提高后代抗刺激隐核虫病的能力,能够有效提高育种的效率和缩短育种年限。
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公开(公告)号:CN113278623B
公开(公告)日:2022-04-12
申请号:CN202110477820.X
申请日:2021-04-29
Applicant: 中国水产科学研究院南海水产研究所 , 南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)
IPC: C12N15/12 , C12N15/11 , C12Q1/6888 , C12Q1/6879
Abstract: 本发明公开了一种卵形鲳鲹性别决定基因Hsd17b1,所述基因Hsd17b1的碱基序列如SEQ ID NO:1所示。还公开了一种与卵形鲳鲹性别相关的SNP位点,所述SNP位点位于上述卵形鲳鲹性别决定基因的第393位,其碱基为G或A。还进一步公开了上述卵形鲳鲹性别决定基因Hsd17b1或上述的SNP位点在卵形鲳鲹性别鉴定方面的应用。以及一种卵形鲳鲹性别鉴定的方法,本发明提高了适用性,降低了成本,提高了准确性,实现了在普通实验室实现任意群体来源的卵形鲳鲹性别的低成本批量检测。
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