一种混合DNA图谱的分析方法

    公开(公告)号:CN114373507A

    公开(公告)日:2022-04-19

    申请号:CN202210100696.X

    申请日:2022-01-27

    IPC分类号: G16B25/10 G16B20/30

    摘要: 本发明提供了一种混合DNA图谱的分析方法,属于法医遗传学和法医物证学技术领域。本发明读取毛细管电泳产生的一代DNA STR图谱数据和相关参数;利用图谱数据和相关参数生成各个基因座的候选基因型集合;利用图谱数据和相关参数确定预设样本参数的先验分布的采样区间;根据确定的预设样本参数的先验分布的采样区间,使用MCMC算法对所述候选基因型集合和样本参数的后验分布进行采样;利用采样得到的候选基因型集合和样本参数的后验分布,统计预设的相关指标,进行混合DNA图谱分析,得到多种分析结果。本发明可以分析一代DNA STR图谱数据,使得图谱分析更客观,同时拆分所有输入的基因座,拆分准确率高。

    一种混合DNA图谱的分析方法

    公开(公告)号:CN114373507B

    公开(公告)日:2022-07-05

    申请号:CN202210100696.X

    申请日:2022-01-27

    IPC分类号: G16B25/10 G16B20/30

    摘要: 本发明提供了一种混合DNA图谱的分析方法,属于法医遗传学和法医物证学技术领域。本发明读取毛细管电泳产生的一代DNA STR图谱数据和相关参数;利用图谱数据和相关参数生成各个基因座的候选基因型集合;利用图谱数据和相关参数确定预设样本参数的先验分布的采样区间;根据确定的预设样本参数的先验分布的采样区间,使用MCMC算法对所述候选基因型集合和样本参数的后验分布进行采样;利用采样得到的候选基因型集合和样本参数的后验分布,统计预设的相关指标,进行混合DNA图谱分析,得到多种分析结果。本发明可以分析一代DNA STR图谱数据,使得图谱分析更客观,同时拆分所有输入的基因座,拆分准确率高。

    一种基于29个Y-STR基因座的复合扩增体系及其使用的引物组合

    公开(公告)号:CN112176068B

    公开(公告)日:2022-08-02

    申请号:CN201910588276.9

    申请日:2019-07-02

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种基于29个Y‑STR基因座的复合扩增体系及其使用的引物组合。本发明所提供的引物组合由序列表中的序列1至序列52所示的52种DNA分子组成。采用所述引物组合构建复合扩增体系,然后进行男性个体的STR分型,检出的多态性高。同时,5个快速突变Y‑STR基因座和7个中国人群Y‑STR基因座均为在中国人群中分辨率较高的中等突变率Y‑STR位点,因此该复合扩增体系不仅具有更高的分辨率和更好的兼容性,而且具有更好的家系代表性,更适用于中国人群,可以大大提高了系统的分辨率及识别能力。本发明具有重要的应用价值。

    可用于九色荧光STR分型的荧光染料、特异性扩增引物对和分型方法

    公开(公告)号:CN111286320B

    公开(公告)日:2022-03-29

    申请号:CN202010075572.1

    申请日:2020-01-22

    发明人: 白雪 叶健 张涛 宋文

    IPC分类号: C12Q1/6876 C09K11/06

    摘要: 本发明公开可用于九色荧光STR分型的荧光染料、特异性扩增引物对和分型方法,包括9种荧光染料,分别为FAM、TET、HEX、NED、ET598、ET618、ET635、ET650和ET680;8个荧光染料FAM、TET、HEX、NED、ET598、ET618、ET635和ET650对41个常染色体STR基因座和1个性别决定基因座Amel的扩增引物进行荧光标记;ET680用于标记内标。本发明的分型方法灵敏度高、结果稳定、图谱完整清晰,重复检测结果无明显差异;stutter峰面积比不超过10%,峰高比不超过15%,具有良好的系统重复性,42个基因座复合扩增体系检测均能得到准确分型结果。

    可用于九色荧光STR分型的荧光染料、特异性扩增引物对和分型方法

    公开(公告)号:CN111286320A

    公开(公告)日:2020-06-16

    申请号:CN202010075572.1

    申请日:2020-01-22

    发明人: 白雪 叶健 张涛 宋文

    摘要: 本发明公开可用于九色荧光STR分型的荧光染料、特异性扩增引物对和分型方法,包括9种荧光染料,分别为FAM、TET、HEX、NED、ET598、ET618、ET635、ET650和ET680;8个荧光染料FAM、TET、HEX、NED、ET598、ET618、ET635和ET650对41个常染色体STR基因座和1个性别决定基因座Amel的扩增引物进行荧光标记;ET680用于标记内标。本发明的分型方法灵敏度高、结果稳定、图谱完整清晰,重复检测结果无明显差异;stutter峰面积比不超过10%,峰高比不超过15%,具有良好的系统重复性,42个基因座复合扩增体系检测均能得到准确分型结果。

    DYS389基因座的等位基因分型标准物的模板

    公开(公告)号:CN106350585B

    公开(公告)日:2019-06-11

    申请号:CN201610752720.2

    申请日:2016-08-29

    IPC分类号: C12Q1/6883 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种DYS389基因座的等位基因分型标准物的模板。本发明所提供的DYS389基因座的等位基因分型标准物的模板为一种DNA组合物,该DNA组合物含有DNA片段1-DNA片段17,核苷酸序列依次如序列表中的序列1、序列2、序列3、序列4、序列5、序列6、序列7、序列8、序列9、序列10、序列11、序列12、序列13、序列14、序列15、序列16和序列17所示。实验证明,本发明提供的模板可扩增获得DYS389基因座的等位基因分型标准物,并可在多种商业试剂盒中使用,具有重要的应用价值。