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公开(公告)号:CN113652438A
公开(公告)日:2021-11-16
申请号:CN202111057596.5
申请日:2021-09-09
Applicant: 云南省农业科学院园艺作物研究所 , 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12N15/53 , C12N9/02 , C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 一种影响萝卜红/紫色性状的RsF3'H等位基因及其鉴定方法,基于来自云南红萝卜特异种质资源的高代自交系RR1(红皮红肉)与加工型白萝卜高代自交系WR1(白皮白肉)杂交产生的F2代遗传群体,构建了相应的遗传图谱,并根据F2代个体的植株(根皮、根肉)花青素含量数据,定位到RsF3'H(LOC108814778)基因是决定萝卜植株具有呈紫色性状潜力或呈红色性状潜力的关键基因,红肉类型萝卜中该基因的单倍型RsF3'H‑RR1与参考序列相比,在第775bp处有一段507bp的碱基插入,这一插入致使RsF3'H‑RR1提前形成了终止密码子而失去功能,使萝卜呈现红色性状。
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公开(公告)号:CN112575010A
公开(公告)日:2021-03-30
申请号:CN202011469612.7
申请日:2020-12-14
Applicant: 云南农业大学 , 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12N15/54 , C12Q1/6809 , C12Q1/6895 , C12N15/11 , G16B20/00 , G16B30/00
Abstract: 本发明涉及一种山药不同组织荧光定量的内参基因及其引物与应用,属于薯蓣山药分子生物学技术领域。所述内参基因CKI‑2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。内参基因CKI‑2的PCR扩增引物核苷酸序列:上游引物如SEQ ID NO.2所示;下游引物如SEQ ID NO.3所示。本发明选取蛋白激酶I、myb、F‑box、肌动蛋白基因、EFl、bHLH13、eIF1、网格重链蛋白等基因作为不同组织的候选基因。通过qRT‑PCR结合RefFind对候选基因的稳定性进行评估,筛选出了在山药不同组织中表达较为稳定的内参基因,为后期开展山药生长发育和代谢机理的基因功能验证等研究工作提供参考依据。
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公开(公告)号:CN113736795A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202111055567.5
申请日:2021-09-09
Applicant: 云南省农业科学院园艺作物研究所 , 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12N15/29 , C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 一种影响萝卜花青素合成的MYB1同源基因及其鉴定方法,基于来自云南红萝卜特异种质资源的高代自交系RR1与加工型白萝卜高代自交系WR1杂交产生的F2代遗传群体,构建了相应的遗传图谱,并根据F2代个体的植株(根皮、根肉)花青素含量数据,定位到RsMYB1.3基因是影响萝卜花青素合成的关键基因,无花青素类型萝卜中该基因由于一个InDel插入而提前形成终止密码子,从而导致植株中无花青素合成。依据该基因在双亲本间的序列差异,设计了一组标记,利用该组标记对苗期萝卜植株叶片组织的DNA进行PCR扩增,依照其电泳结果可对RsMYB1.3在无花青素合成萝卜及云南红萝卜中的基因型进行鉴定。
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公开(公告)号:CN112501183A
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN202011469619.9
申请日:2020-12-14
Applicant: 云南农业大学 , 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/11 , C12Q1/6809 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明涉及一种山药不同生长时间段荧光定量的内参基因及其引物与应用,属于薯蓣山药分子生物学技术领域。所述内参基因F‑box的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。内参基因F‑box的PCR扩增引物核苷酸序列:上游引物如SEQ ID NO.2所示;下游引物如SEQ ID NO.3所示。本发明筛选出了在山药不同生长时间段表达较为稳定的内参基因,为后期开展山药生长发育和代谢机理的基因功能验证等研究工作提供参考依据。
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公开(公告)号:CN107988337A
公开(公告)日:2018-05-04
申请号:CN201711080527.X
申请日:2017-11-06
Applicant: 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于农作物分子遗传育种学领域,具体涉及一种抗稻瘟水稻鉴定方法和基因的标记方法及其应用,包括如下步骤:检测待测水稻第6号染色体中Pid2基因序列FJ915121.1序列及其同源序列5’末端起第5352和5353碱基处SNP位点,通过PCR扩增及限制性内切酶酶切对水稻第6号染色体中Pid2基因序列FJ915121.1序列及其同源序列5’末端起第5352和5353碱基处SNP类型进行鉴定。本发明可以准确判断所选择水稻植株是否含有抗稻瘟病基因Pid2,利用这种方法可以有效地对抗稻瘟病基因pid2基因型选择,既可以用于水稻资源的鉴定筛选,又可以用于水稻抗稻瘟病基因Pid2的分子育种。
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公开(公告)号:CN116814844A
公开(公告)日:2023-09-29
申请号:CN202311081561.4
申请日:2023-08-25
Applicant: 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明涉及一种用于检测水稻耐冷基因CTB4a的分子标记及应用,所述分子标记是特异性分子标记,位于CTB4a编码基因的SNP‑1930处。所述特异性分子标记的SNP位点碱基多态性为G/C;若该位点处碱基为G,则待测水稻材料具有耐冷性基因CTB4a,若该位点处碱基为C,则待测水稻材料则携带有CTB4a的非耐冷性基因单倍型类型ctb4a。所述特异性分子标记的检测引物组合包括引物ctb4a‑1930 F和ctb4a‑1930 R,以及限制性内切酶HindⅢ。本发明特异性分子标记的应用为在水稻耐冷基因CTB4a鉴定中的应用。所述引物组合在水稻种质资源鉴定、筛选中的应用及在耐冷能性水稻品种选育中的应用。
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公开(公告)号:CN112501183B
公开(公告)日:2022-11-08
申请号:CN202011469619.9
申请日:2020-12-14
Applicant: 云南农业大学 , 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/11 , C12Q1/6809 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明涉及一种山药不同生长时间段荧光定量的内参基因及其引物与应用,属于薯蓣山药分子生物学技术领域。所述内参基因F‑box的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。内参基因F‑box的PCR扩增引物核苷酸序列:上游引物如SEQ ID NO.2所示;下游引物如SEQ ID NO.3所示。本发明筛选出了在山药不同生长时间段表达较为稳定的内参基因,为后期开展山药生长发育和代谢机理的基因功能验证等研究工作提供参考依据。
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公开(公告)号:CN107988337B
公开(公告)日:2021-04-13
申请号:CN201711080527.X
申请日:2017-11-06
Applicant: 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于农作物分子遗传育种学领域,具体涉及一种抗稻瘟水稻鉴定方法和基因的标记方法及其应用,包括如下步骤:检测待测水稻第6号染色体中Pid2基因序列FJ915121.1序列及其同源序列5’末端起第5352和5353碱基处SNP位点,通过PCR扩增及限制性内切酶酶切对水稻第6号染色体中Pid2基因序列FJ915121.1序列及其同源序列5’末端起第5352和5353碱基处SNP类型进行鉴定。本发明可以准确判断所选择水稻植株是否含有抗稻瘟病基因Pid2,利用这种方法可以有效地对抗稻瘟病基因pid2基因型选择,既可以用于水稻资源的鉴定筛选,又可以用于水稻抗稻瘟病基因Pid2的分子育种。
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公开(公告)号:CN116837129A
公开(公告)日:2023-10-03
申请号:CN202310698247.4
申请日:2023-06-13
Applicant: 云南农业大学 , 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 , 富源谷子地农业综合开发有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12N15/29 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种山药不同生长期珠芽荧光定量的内参基因及其引物与应用,属于山药分子生物学技术领域。所述内参基因F‑BOX‑2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。所述内参基因F‑BOX‑2的PCR扩增引物核苷酸序列:上游引物如SEQ ID NO.2所示;下游引物如SEQ ID NO.3所示。本发明筛选出在山药不同生长期珠芽里表达极稳定的内参基因,能最大程度减小基因表达量评估的误差,筛选出的内参基因的可靠性高,为以后研究山药珠芽生长发育相关基因奠定了基础。
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公开(公告)号:CN116751884A
公开(公告)日:2023-09-15
申请号:CN202310698257.8
申请日:2023-06-13
Applicant: 云南农业大学 , 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 , 富源谷子地农业综合开发有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12N15/29 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种山药不同部位茎蔓荧光定量的内参基因及其引物与应用,属于薯蓣山药分子生物学技术领域。所述内参基因MYB7的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。内参基因MYB7的PCR扩增引物核苷酸序列:上游引物如SEQ ID NO.2所示;下游引物如SEQ ID NO.3所示。本发明筛选出了在山药不同部位茎蔓表达较为稳定的内参基因,为后期开展山药茎蔓生长发育和代谢机理的基因功能验证等研究工作提供参考依据。
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