用于扩增土壤线虫COI基因的简并引物组合及其应用

    公开(公告)号:CN103045589B

    公开(公告)日:2014-02-19

    申请号:CN201210571488.4

    申请日:2012-12-25

    申请人: 北京大学

    IPC分类号: C12N15/11 C12Q1/68

    摘要: 本发明提供一种用于扩增土壤线虫COI基因的简并引物组合,所述引物组合包括7COX1JB-F1和7COX1JB-R1以及7COX1JB-F2和7COX1JB-R2(如Seq ID No.1-4所示)。本发明利用巢式PCR的方法扩增出土壤线虫的部分COI基因片段,利用该片段可以有效地对土壤线虫进行分类鉴定,对操作人员要求不高,只需熟练PCR操作即可,即使完全没有线虫形态分类鉴定知识的人也可轻松完成,且一次巢式PCR就可以同时完成大量样品的分类鉴定,节约了鉴定时间,与传统方法相比,本发明选择了COI基因,分辨率更高,可以更有效地对土壤线虫进行种的区分,同时填补了土壤线虫分类鉴定领域的空白。

    一种检测转基因作物外源基因对土壤线虫安全性的方法

    公开(公告)号:CN103695541B

    公开(公告)日:2015-07-22

    申请号:CN201310682486.7

    申请日:2013-12-12

    申请人: 北京大学

    IPC分类号: C12Q1/68 C12Q1/02 C12R1/19

    摘要: 本发明提供一种检测转基因作物外源基因对土壤线虫安全性的方法,通过生物信息学分析获得转基因植物中外源基因与秀丽隐杆线虫基因组中相同短片段,通过将短片段克隆和转化来饲喂秀丽隐杆线虫,根据秀丽隐杆线虫的表型差异来检测外源基因对线虫的安全性。以往转基因作物的安全性评价集中在取食外源蛋白对非靶标生物影响,本发明用于检测外源基因对线虫这类重要土壤生态系统组成者的安全性问题,填补了这一转基因作物安全评价领域的空白。本发明是利用饲喂的方法来进行RNAi,不需要特殊的试剂和仪器,线虫饲养容易,方法简单易行。

    一种检测转基因作物外源基因对土壤线虫安全性的方法

    公开(公告)号:CN103695541A

    公开(公告)日:2014-04-02

    申请号:CN201310682486.7

    申请日:2013-12-12

    申请人: 北京大学

    IPC分类号: C12Q1/68 C12Q1/02 C12R1/19

    摘要: 本发明提供一种检测转基因作物外源基因对土壤线虫安全性的方法,通过生物信息学分析获得转基因植物中外源基因与秀丽隐杆线虫基因组中相同短片段,通过将短片段克隆和转化来饲喂秀丽隐杆线虫,根据秀丽隐杆线虫的表型差异来检测外源基因对线虫的安全性。以往转基因作物的安全性评价集中在取食外源蛋白对非靶标生物影响,本发明用于检测外源基因对线虫这类重要土壤生态系统组成者的安全性问题,填补了这一转基因作物安全评价领域的空白。本发明是利用饲喂的方法来进行RNAi,不需要特殊的试剂和仪器,线虫饲养容易,方法简单易行。

    用于扩增土壤线虫COI基因的简并引物组合及其应用

    公开(公告)号:CN103045589A

    公开(公告)日:2013-04-17

    申请号:CN201210571488.4

    申请日:2012-12-25

    申请人: 北京大学

    IPC分类号: C12N15/11 C12Q1/68

    摘要: 本发明提供一种用于扩增土壤线虫CO I基因的简并引物组合,所述引物组合包括7COX1JB-F1和7COX1JB-R1以及7COX1JB-F2和7COX1JB-R2(如Seq ID No.1-4所示)。本发明利用巢式PCR的方法扩增出土壤线虫的部分COI基因片段,利用该片段可以有效地对土壤线虫进行分类鉴定,对操作人员要求不高,只需熟练PCR操作即可,即使完全没有线虫形态分类鉴定知识的人也可轻松完成,且一次巢式PCR就可以同时完成大量样品的分类鉴定,节约了鉴定时间,与传统方法相比,本发明选择了CO I基因,分辨率更高,可以更有效地对土壤线虫进行种的区分,同时填补了土壤线虫分类鉴定领域的空白。