公开(公告)号：CN112786102B

公开(公告)日：2022-10-21

申请号：CN202110099309.0

申请日：2021-01-25

申请人： 北京大学

发明人： 陈倩 ,  钟浩辉 ,  刘树枫 ,  倪晋仁

IPC分类号： G16B10/00 ,  G16B20/00 ,  G16B50/10 ,  G16B50/00 ,  G16B40/00

摘要： 本发明公开了一种基于宏基因组学分析精准识别水体中未知微生物群落的方法，所述方法包括步骤(1)自水样提取宏基因组DNA；(2)DNA测序；(3)根据目标群落选择性构建参考数据库；(4)对测序数据进行组装获得组装数据；(5)对组装数据进行分箱；(6)对分箱数据进行质量测试，标记MAGs的质量，并计算测序深度；(7)根据构建的参考数据库对组装数据进行注释；(8)对MAGs做进化关系分析，进而做出宏基因组群落结构分析。本发明不依赖更新速度较慢的大型软件配套数据库，适合处理未知物种较多的样本，且可检测极低丰度物种，检测全面、快速。

公开(公告)号：CN112786102A

公开(公告)日：2021-05-11

申请号：CN202110099309.0

申请日：2021-01-25

申请人： 北京大学

发明人： 陈倩 ,  钟浩辉 ,  刘树枫 ,  倪晋仁

IPC分类号： G16B10/00 ,  G16B20/00 ,  G16B50/10 ,  G16B50/00 ,  G16B40/00

摘要： 本发明公开了一种基于宏基因组学分析精准识别水体中未知微生物群落的方法，所述方法包括步骤(1)自水样提取宏基因组DNA；(2)DNA测序；(3)根据目标群落选择性构建参考数据库；(4)对测序数据进行组装获得组装数据；(5)对组装数据进行分箱；(6)对分箱数据进行质量测试，标记MAGs的质量，并计算测序深度；(7)根据构建的参考数据库对组装数据进行注释；(8)对MAGs做进化关系分析，进而做出宏基因组群落结构分析。本发明不依赖更新速度较慢的大型软件配套数据库，适合处理未知物种较多的样本，且可检测极低丰度物种，检测全面、快速。