公开(公告)号：CN108728515A

公开(公告)日：2018-11-02

申请号：CN201810585283.9

申请日：2018-06-08

申请人： 北京泛生子基因科技有限公司

发明人： 王沛 ,  马兴勇 ,  谭达 ,  杨洁 ,  李光宇 ,  阎海 ,  王思振 ,  王晓月 ,  焦宇辰

IPC分类号： C12Q1/6806 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06 ,  G06F19/22

摘要： 本发明公开了一种使用duplex方法检测ctDNA低频突变的文库构建和测序数据的分析方法。本发明提供了一种构建用于检测ctDNA低频突变的文库的方法，依次包括如下步骤：(1)将ctDNA样本依次进行末端修复和3’端加A处理；(2)将步骤(1)处理后的ctDNA与接头混合物连接，经过PCR扩增后得到文库。本发明具有以下优点：1、使用了barcode标签，并将其简化为4bp长的序列组合，提高利用率，提高检测灵敏度，合成简单，成本低，使用方便，极大的提高了adapter的连接效率和测序数据中duplex标记分子的比例。2、使用的识别duplex的生物信息分析方法，可以快速有效去除测序、捕获和PCR过程中引入的错误，降低检测的假阳性。