公开(公告)号：CN107760792A

公开(公告)日：2018-03-06

申请号：CN201711262136.X

申请日：2017-12-04

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 杜小勇 ,  赵书红 ,  倪攀 ,  李新云 ,  余梅 ,  杨慧 ,  陈俭海 ,  李京津 ,  王海燕 ,  章程 ,  江帆

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于山羊分子标记筛选与应用技术领域，具体涉及山羊NOD1基因的一个SNP分子标记及应用。所述的分子标记是从山羊NOD1基因外显子中克隆得到，本发明还包括山羊NOD1基因外显子序列突变位点的检测方法与应用。本发明通过制备筛选得到一种山羊感染性状(FEC)相关的SNP分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在序列表SEQ ID NO:1所示序列的第301bp处存在一个G/A碱基突变，该突变导致PCR-FokI-RFLP多态性。本发明还公开了该分子标记的筛选方法及其在山羊的感染性状(FEC)关联分析中的应用。

公开(公告)号：CN107760792B

公开(公告)日：2021-03-16

申请号：CN201711262136.X

申请日：2017-12-04

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 杜小勇 ,  赵书红 ,  倪攀 ,  李新云 ,  余梅 ,  杨慧 ,  陈俭海 ,  李京津 ,  王海燕 ,  章程 ,  江帆

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于山羊分子标记筛选与应用技术领域，具体涉及山羊NOD1基因的一个SNP分子标记及应用。所述的分子标记是从山羊NOD1基因外显子中克隆得到，本发明还包括山羊NOD1基因外显子序列突变位点的检测方法与应用。本发明通过制备筛选得到一种山羊感染性状(FEC)相关的SNP分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在序列表SEQ ID NO:1所示序列的第301bp处存在一个G/A碱基突变，该突变导致PCR‑FokI‑RFLP多态性。本发明还公开了该分子标记的筛选方法及其在山羊的感染性状(FEC)关联分析中的应用。

公开(公告)号：CN108265103A

公开(公告)日：2018-07-10

申请号：CN201611270166.0

申请日：2016-12-30

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 赵书红 ,  谢胜松 ,  倪攀 ,  陈俭海 ,  李世军 ,  韩晓松 ,  刘向东 ,  杜小勇 ,  马云龙 ,  赵长志

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开了一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒及其应用，该试剂盒包括靶向猪线粒体基因组序列的捕获探针，所述的捕获探针由生物素标记的核苷酸序列组成，核苷酸序列如SEQ ID NO：1-106所示，获取猪线粒体基因组序列的方法包括以下步骤：1）提取猪的基因组DNA；2）构建猪的全基因组文库；3）与捕获探针液相杂交、测序、序列拼接，即可获取猪线粒体基因组序列，该方法尤其适用于靶向捕获猪古DNA中线粒体基因组序列，其灵敏度高，特异性强，且稳定性好，与核酸文库结合捕获效率更高，覆盖度能达到99.99%，且检测成本低。

公开(公告)号：CN108265103B

公开(公告)日：2021-07-09

申请号：CN201611270166.0

申请日：2016-12-30

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 赵书红 ,  谢胜松 ,  倪攀 ,  陈俭海 ,  李世军 ,  韩晓松 ,  刘向东 ,  杜小勇 ,  马云龙 ,  赵长志

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开了一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒及其应用，该试剂盒包括靶向猪线粒体基因组序列的捕获探针，所述的捕获探针由生物素标记的核苷酸序列组成，核苷酸序列如SEQ ID NO：1‑106所示，获取猪线粒体基因组序列的方法包括以下步骤：1）提取猪的基因组DNA；2）构建猪的全基因组文库；3）与捕获探针液相杂交、测序、序列拼接，即可获取猪线粒体基因组序列，该方法尤其适用于靶向捕获猪古DNA中线粒体基因组序列，其灵敏度高，特异性强，且稳定性好，与核酸文库结合捕获效率更高，覆盖度能达到99.99%，且检测成本低。

公开(公告)号：CN109136351A

公开(公告)日：2019-01-04

申请号：CN201710501021.5

申请日：2017-06-27

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 赵书红 ,  谢胜松 ,  韩晓松 ,  赵长志 ,  苗义良 ,  李新云 ,  倪攀 ,  刘向东 ,  李长春 ,  徐学文 ,  马云龙 ,  高杨 ,  陈毅龙 ,  杨高娟

IPC: C12Q1/6869

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q2535/122

Abstract: 本发明提供了一种通过扩增子高通量测序技术检测sgRNA活性和特异性的方法。具体地，本发明的方法可同时获得目标靶点和非目标靶点的扩增子，通过对扩增子建库和高通量测序可获得多个sgRNA靶点和脱靶位点的基因组切割效率，同时还能获知其Indel突变序列特征，从而快速、简便、全面而准确地评估sgRNA的活性和特异性。