用于检测水稻抗褐飞虱Bph3基因的SNP分子标记及应用

    公开(公告)号:CN107868842B

    公开(公告)日:2021-07-06

    申请号:CN201711262413.7

    申请日:2017-12-04

    IPC分类号: C12Q1/6895 C12N15/11

    摘要: 本发明提供用于检测水稻抗褐飞虱基因Bph3的SNP分子标记及应用。本发明公开了与水稻抗褐飞虱基因Bph3共分离及扩增效果良好的SNP标记K_040503,该标记检测水稻第4号染色体6903106位碱基,多态性为C/G。基于KASP技术开发的标记K_040503引物序列如SEQ ID No.1‑3所示。本发明的SNP分子标记检测Bph3基因位点为高特异性的位点,可便捷高效的用于鉴定水稻品种中是否含有Bph3基因。本发明提供的SNP分子标记的应用方法准确可靠,操作简便,适用于Bph3基因的鉴定及辅助选择育种。

    白叶枯病抗性基因Xa21辅助育种分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN107236811A

    公开(公告)日:2017-10-10

    申请号:CN201710539202.7

    申请日:2017-07-04

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明提供白叶枯病抗性基因Xa21辅助育种分子标记,所述分子标记是与水稻白叶枯病抗性基因Xa21共分离的SNP标记RSXA211110,该SNP标记检测水稻第11号染色体20894905位碱基;基于KASP技术开发的该SNP标记的引物,包括特异引物X、特异引物Y和通用引物C,引物序列分别如SEQ ID NO:1‑3所示。本发明还提供SNP标记RSXA211110在白叶枯病抗性基因Xa21辅助育种中的应用。本发明具有操作简单、成本低廉、周期短的优点,而且该标记的稳定性好,不受其它基因效应和环境因素的影响,可在早代选择,缩短育种年限,提高育种效率,对水稻抗白叶枯的品种改良具有重要意义,适用于Xa21基因的辅助选择育种。

    水稻抗白叶枯基因xa5的SNP标记开发和应用

    公开(公告)号:CN109628629A

    公开(公告)日:2019-04-16

    申请号:CN201811513664.2

    申请日:2018-12-11

    IPC分类号: C12Q1/6895 C12N15/11

    摘要: 本发明提供了一种与抗白叶枯基因xa5紧密连锁的SNP分子标记K_050527,该SNP标记检测水稻第5号染色体的第437500位点处碱基为C或G,基于KASP技术开发的该SNP标记的引物组合为Primer X、Primer Y和Primer C。本发明利用KASP技术对与抗白叶枯基因xa5紧密连锁的SNP标记进行基因快速分型,可以高、中、低通量的应用在商业化分子育种中;同时开发SNP标记表型的选择效率达到100%,可在籼稻、粳稻等不同种质资源中快速、精准的检测广谱抗白叶枯基因xa5;并且在检测过程中不需要酶切、电泳及测序等繁琐的程序,减少了气溶胶的污染以及溴化乙锭EB(ethidium bromide)等有毒物的使用,可在育种早期进行前景的分子标记辅助选择,减小育种群体的大田种植规模,降低育种成本,加快育种进程。

    水稻广谱抗稻瘟病基因Pigm的SNP标记开发和应用

    公开(公告)号:CN109628627A

    公开(公告)日:2019-04-16

    申请号:CN201811512430.6

    申请日:2018-12-11

    IPC分类号: C12Q1/6895 C12N15/11

    摘要: 本发明提供了一种与抗稻瘟病基因Pigm紧密连锁的SNP分子标记K_060508,该SNP标记检测水稻第6号染色体的第10421726位点处碱基为G或A,基于KASP技术开发的该SNP标记的引物组合为Primer X、Primer Y和Primer C。本发明利用KASP技术对与抗稻瘟病基因Pigm紧密连锁的SNP标记进行基因快速分型,可以高、中、低通量的应用在商业化分子育种中;同时开发SNP标记表型的选择效率达到100%,可在籼稻、粳稻等不同种质资源中快速、精准的检测广谱抗稻瘟病基因Pigm;并且在检测过程中不需要酶切、电泳及测序等繁琐的程序,减少了气溶胶的污染以及EB(ethidium bromide)等有毒物的使用,可在育种早期进行前景的分子标记辅助选择,减小育种群体的大田种植规模,降低育种成本,加快育种进程。