-
公开(公告)号:CN114944198A
公开(公告)日:2022-08-26
申请号:CN202210561789.2
申请日:2022-05-23
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明设计一种计算机处理采集设备数据的融合方法,先利用空间型相关性解释对空间转录组数据矩阵进行反卷积算法,利用单细胞信息点获得特异性基因,对单细胞信息点进行降维聚类之后,找到每个细胞信息簇中特异性表达的基因数据,对空间转录组数据矩阵进行反卷积操作,在获得了不同细胞类型的特异性基因数据之后,首先利用半监督主题模型对单细胞信息点进行训练,通过比较主题和细胞类型的相关性,来调整模型的参数;调完参数之后再将空间转录组数据矩阵放入到模型中训练,获得空间转录组数据矩阵中每个细胞信息捕获点S的主题分布情况,即细胞类型组成;然后根据细胞类型组成提高空间转录组数据矩阵图谱分辨率;本发明更有利于生物上的研究。
-
公开(公告)号:CN114944198B
公开(公告)日:2024-09-10
申请号:CN202210561789.2
申请日:2022-05-23
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明设计一种计算机处理采集设备数据的融合方法,先利用空间型相关性解释对空间转录组数据矩阵进行反卷积算法,利用单细胞信息点获得特异性基因,对单细胞信息点进行降维聚类之后,找到每个细胞信息簇中特异性表达的基因数据,对空间转录组数据矩阵进行反卷积操作,在获得了不同细胞类型的特异性基因数据之后,首先利用半监督主题模型对单细胞信息点进行训练,通过比较主题和细胞类型的相关性,来调整模型的参数;调完参数之后再将空间转录组数据矩阵放入到模型中训练,获得空间转录组数据矩阵中每个细胞信息捕获点S的主题分布情况,即细胞类型组成;然后根据细胞类型组成提高空间转录组数据矩阵图谱分辨率;本发明更有利于生物上的研究。
-