基于改进Transformer模型的RNA状态推断研究方法

    公开(公告)号:CN113393900A

    公开(公告)日:2021-09-14

    申请号:CN202110644508.5

    申请日:2021-06-09

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于改进Transformer模型的RNA状态推断研究方法,其方法为:第一步:搭建所需要的模块;第二步:进行模型训练数据清洗;第三步:设置训练次数;第四步:计算损失和调整模型参数;第五步:获取模拟的人工Shape‑Data;第六步:预测RNA序列上配对碱基。有益效果:结合生物领域和深度学习领域的知识进行交叉研究,利用计算机模拟算法来节省昂贵的生物实验,为分子生物学领域的研究人员提供更加方便高效的研究工具,同时也为在预测RNA二级结构的方向上进一步证明软约束在RNA二级结构预测模型上对提高模型准确性方面可以有很大的研究价值。

    基于改进Transformer模型的RNA状态推断研究方法

    公开(公告)号:CN113393900B

    公开(公告)日:2022-08-02

    申请号:CN202110644508.5

    申请日:2021-06-09

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于改进Transformer模型的RNA状态推断研究方法,其方法为:第一步:搭建所需要的模块;第二步:进行模型训练数据清洗;第三步:设置训练次数;第四步:计算损失和调整模型参数;第五步:获取模拟的人工Shape‑Data;第六步:预测RNA序列上配对碱基。有益效果:结合生物领域和深度学习领域的知识进行交叉研究,利用计算机模拟算法来节省昂贵的生物实验,为分子生物学领域的研究人员提供更加方便高效的研究工具,同时也为在预测RNA二级结构的方向上进一步证明软约束在RNA二级结构预测模型上对提高模型准确性方面可以有很大的研究价值。

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