基于目标特征预测突变致病性分析方法、系统及设备

    公开(公告)号:CN115458055A

    公开(公告)日:2022-12-09

    申请号:CN202211290688.2

    申请日:2022-10-21

    IPC分类号: G16B20/50 G06N20/00 G06K9/62

    摘要: 本发明涉及基于目标特征预测突变致病性分析方法、系统及设备。包括:获取待预测基因的突变;将待预测基因的突变映射到所述待预测基因的蛋白结构上,得到映射了突变的蛋白结构;再对映射了突变的蛋白结构进行特征提取,得到突变蛋白结构特征;然后对突变蛋白结构特征进行特征选择,得到特征选择结果;最后将特征选择结果输入到分类预测模型,得到突变为致病突变或良性突变的分类结果。本发明方法旨在基于突变蛋白结构特征中的目标特征进行预测突变,发掘其对突变致病性的高预测能力和潜在应用价值。

    基于RSA预测突变致病性分析方法、系统及设备

    公开(公告)号:CN115472220A

    公开(公告)日:2022-12-13

    申请号:CN202211290675.5

    申请日:2022-10-21

    IPC分类号: G16B20/50 G16B20/30

    摘要: 本发明涉及基于RSA预测突变致病性分析方法、系统及设备。包括:获取待预测基因的突变;将待预测基因的突变映射到待预测基因的蛋白结构上,得到映射了突变的蛋白结构;对映射了突变的蛋白结构进行特征提取,得到突变蛋白结构特征;将待预测基因的突变输入基因家族分析器,得到待预测基因的突变所属基因家族;当所属基因家族为离子通道时,选择突变蛋白结构特征中的RSA进行预测,得到突变为致病突变或良性突变的分类结果。本发明方法旨在基于突变蛋白结构特征中的RSA进行预测待预测基因的突变,发掘其对突变致病性的高预测能力和潜在应用价值。

    基于SIGMA+预测突变致病性分析方法、系统及设备

    公开(公告)号:CN115458054A

    公开(公告)日:2022-12-09

    申请号:CN202211290674.0

    申请日:2022-10-21

    IPC分类号: G16B20/50 G06N20/00 G06K9/62

    摘要: 本发明涉及基于SIGMA+预测突变致病性分析方法、系统及设备。包括:获取待预测基因的突变;将待预测基因的突变映射到待预测基因的蛋白结构上,得到映射了突变的蛋白结构;将映射了突变的蛋白结构输入SIGMA模型,得到待预测基因的结构特征得分;再将待预测基因的突变输入预测器,得到待预测基因的变异效应得分;将待预测基因的结构特征得分和变异效应得分输入分类器,得到突变为致病突变或良性突变的分类结果。本发明方法旨在基于待预测基因的突变和映射了突变的蛋白结构信息将SIGMA与其他预测器相结合,发掘其对突变致病性的高预测能力和潜在应用价值。

    基于SIGMA预测突变致病性分析方法、系统及设备

    公开(公告)号:CN115691666A

    公开(公告)日:2023-02-03

    申请号:CN202211290686.3

    申请日:2022-10-21

    摘要: 本发明涉及基于SIGMA预测突变致病性分析方法、系统及设备。包括:获取待预测基因的突变;将待预测基因的突变映射到待预测基因的蛋白结构上,得到映射了突变的蛋白结构;对映射了突变的蛋白结构进行特征提取,得到突变蛋白结构特征;然后将突变蛋白结构特征输入SIGMA模型,得到突变为致病突变或良性突变的分类结果;所述突变蛋白结构特征包括蛋白质水平特征、残基水平特征、突变水平特征。本发明方法基于SIGMA模型和突变蛋白结构特征预测突变致病性,发掘其对变异致病性的高预测能力和潜在应用价值,对基因数据突变致病性分析研究产生有益的推动作用。