公开(公告)号：CN113584176A

公开(公告)日：2021-11-02

申请号：CN202111031784.0

申请日：2021-09-03

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 曾德军 ,  单光耀 ,  卞赟艺 ,  胡正阳 ,  易彦均 ,  云丽娅 ,  詹成 ,  林宗武

IPC: C12Q1/6886 ,  G06Q10/04 ,  G16B20/50

Abstract: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞中TP53通路相关基因突变的基因组合物以及预测模型和方法。本发明通过运用RNA测序、Lasso回归和二分类Logistic回归筛选与肺腺癌细胞中TP53通路相关的基因(MDM2、ATM、TP53)，并构建评分Score，通过ROC分析得到肺腺癌中Score相应的截断值，可用于肺腺癌细胞中TP53通路相关基因是否突变的预测。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经验证发现该预测方法具有特异性好、准确性高的优点，有很好的应用前景。

公开(公告)号：CN113584176B

公开(公告)日：2023-06-30

申请号：CN202111031784.0

申请日：2021-09-03

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 曾德军 ,  单光耀 ,  卞赟艺 ,  胡正阳 ,  易彦均 ,  云丽娅 ,  詹成 ,  林宗武

IPC: C12Q1/6886 ,  G16B20/50 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞中TP53通路相关基因突变的基因组合物以及预测模型和方法。本发明通过运用RNA测序、Lasso回归和二分类Logistic回归筛选与肺腺癌细胞中TP53通路相关的基因(MDM2、ATM、TP53)，并构建评分Score，通过ROC分析得到肺腺癌中Score相应的截断值，可用于肺腺癌细胞中TP53通路相关基因是否突变的预测。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经验证发现该预测方法具有特异性好、准确性高的优点，有很好的应用前景。