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公开(公告)号:CN115873955B
公开(公告)日:2024-08-23
申请号:CN202211664856.X
申请日:2022-12-22
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明公开了一种用于评估顺铂治疗肺腺癌敏感性的试剂盒。本发明首先基于一系列细胞实验,结果发现基因RETSAT对铁死亡具有重要的介导作用,由此推断,RETSAT适合于作为预后指标判断肺腺癌患者对顺铂治疗的敏感性。随后采用qPCR的方法检测34例接受顺铂治疗的患者手术切除标本中RETSAT的表达情况,并分析其预后情况,发现RETSAT高表达的患者对顺铂治疗的反应较低表达患者更为敏感,预后较好。因此,RETSAT的表达水平可以用于预判肺腺癌患者对顺铂治疗是否敏感或耐药,利用现有的检测试剂即可方便地检测RETSAT的表达量,具有良好的临床应用价值和推广应用价值。
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公开(公告)号:CN117106914A
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202311103497.5
申请日:2023-08-30
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种培美曲塞/顺铂联合化疗治疗肺腺癌预后评估的ODC1基因标志物及其应用,一方面提出ODC1基因在制备培美曲塞/顺铂联合化疗治疗肺腺癌预后评估的试剂中的应用,ODC1基因的Ensembl号为ENST00000234111.9,同时还提出一种用于评估肺腺癌对培美曲塞/顺铂联合化疗敏感性的试剂盒,其包含检测ODC1表达量的试剂。本发明基于细胞实验和临床数据验证发现ODC1基因对铁死亡具有重要的介导作用,其表达水平与细胞对铁死亡诱导剂及联合化疗处理的敏感性相关,作为生物标志物来辅助预判肺腺癌患者对化疗的敏感性或耐受性,具有重要的临床应用价值。
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公开(公告)号:CN115747332A
公开(公告)日:2023-03-07
申请号:CN202211251112.5
申请日:2022-10-13
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/10 , G16B20/50
Abstract: 本发明公开了一种检测肺腺癌SMAD4突变的试剂盒。本发明通过运用limma包筛选与SMAD4密切相关的差异基因,通过Lasso回归最终挑选出13个基因TRIM48,HS3ST1,GPA33,STK39,GPR110,IPCEF1,ALPPL2,KCNQ3,ADAM28,CDC42EP1,ZBTB18,MYCN和HKDC1,并通过logistic回归构建上述基因组成的评分模型;绘制受试者工作特征曲线获得截断值,可用于肺腺癌SMAD4突变的检测。实验验证该方法具有灵敏度、特异度高的特点,有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN113444793B
公开(公告)日:2022-09-23
申请号:CN202110597293.6
申请日:2021-05-31
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
Abstract: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒,所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂:RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,实验以及多组学数据库验证,发现该预测方法具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN119639900A
公开(公告)日:2025-03-18
申请号:CN202411930542.9
申请日:2024-12-25
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了KLF13在制备检测肺腺癌铁死亡及顺铂敏感性检测试剂中的用途及检测试剂和试剂盒。本发明基于一系列分子生物学实验,证明KLF13的高表达促进肺腺癌铁死亡并增加化疗敏感性。本发明首次提出了KLF13可作为生物标志物用于判断肺腺癌对铁死亡及顺铂的敏感性;通过检测KLF13表达来判断肺腺癌对铁死亡及顺铂的敏感性,具有操作简便、高敏感性、特异性的优点,因此,具有临床推广应用价值。
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公开(公告)号:CN113564259B
公开(公告)日:2023-09-26
申请号:CN202111020869.9
申请日:2021-09-01
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/113
Abstract: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明通过运用RNA测序、套索算法(LASSO)和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA,并构建评分score,进而通过受试者工作曲线(ROC)分析得到肺腺癌中score相应的截断值,可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高,特异性强的优点,具有较好的应用前景。
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公开(公告)号:CN115873955A
公开(公告)日:2023-03-31
申请号:CN202211664856.X
申请日:2022-12-22
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明公开了一种用于评估顺铂治疗肺腺癌敏感性的试剂盒。本发明首先基于一系列细胞实验,结果发现基因RETSAT对铁死亡具有重要的介导作用,由此推断,RETSAT适合于作为预后指标判断肺腺癌患者对顺铂治疗的敏感性。随后采用qPCR的方法检测34例接受顺铂治疗的患者手术切除标本中RETSAT的表达情况,并分析其预后情况,发现RETSAT高表达的患者对顺铂治疗的反应较低表达患者更为敏感,预后较好。因此,RETSAT的表达水平可以用于预判肺腺癌患者对顺铂治疗是否敏感或耐药,利用现有的检测试剂即可方便地检测RETSAT的表达量,具有良好的临床应用价值和推广应用价值。
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公开(公告)号:CN115521983A
公开(公告)日:2022-12-27
申请号:CN202211232114.X
申请日:2022-10-10
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/00
Abstract: 本发明提供了一种检测实体肿瘤细胞对铁死亡诱导剂(erastin,RSL3,ML210,ML162)敏感度的组合物及其应用,所述组合物由检测相关基因表达量的试剂组成。本发明运用RNA测序、套索分析(LASSO)筛选出与铁死亡诱导剂敏感性显著相关的基因,并利用逻辑(Logistic)回归构建评分Predictive value,通过受试者工作曲线(ROC)分析得到实体肿瘤细胞中Predictive value相应的最佳界值,可用于预测实体肿瘤细胞对常用铁死亡药物的敏感度。该发明通过利用基因组合物表达量来预测实体肿瘤细胞对常用铁死亡药物的敏感度,具有灵敏度高,特异性好的优点,有较好的应用前景。
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公开(公告)号:CN119684409A
公开(公告)日:2025-03-25
申请号:CN202411983966.1
申请日:2024-12-31
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明涉及生物技术领域,具体是一种抑制SUMO2蛋白第11位赖氨酸乳酸化的细胞穿梭肽(CPP)及其应用。该细胞穿梭肽由人免疫缺陷病毒(HIV‑1)的转录反式激活因子(TAT)融合SUMO2的一段多肽组成,经细胞、类器官和动物实验发现CPP‑SUMO2能够抑制肺腺癌细胞内SUMO2蛋白的乳酸化并提高其对铁死亡诱导剂和顺铂的敏感度。经验证发现该穿梭肽具特异性好、副作用小的优点,有较好的应用前景。
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公开(公告)号:CN113736888B
公开(公告)日:2024-02-23
申请号:CN202111161269.4
申请日:2021-09-30
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明提供了一种检测肺鳞癌抗氧化应激驱动通路相关基因突变的试剂、试剂盒和方法,本发明通过运用RNA测序、Lasso套索算法特征筛选抗氧化应激通路相关的基因,通过构建评分RiskScore,运用二分类logistic回归构建模型,并通过ROC曲线得到肺鳞癌中评分RiskScore的最佳截断值,可用于肺鳞癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测;本发明通过利用各个基因组合得到的表达量来预测肺鳞癌特定驱动通路基因突变,经TCGA数据库验证,该方法具有灵敏度高、特异性好的优点,可以有效指导肺鳞癌患者的个体化治疗,为精准治疗和个体化治疗添加更多重要的希冀,提高临床获益。
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