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公开(公告)号:CN116758993A
公开(公告)日:2023-09-15
申请号:CN202310718721.5
申请日:2023-06-16
Applicant: 大连海事大学
IPC: G16B40/00 , G16B20/30 , G16B5/00 , G06F18/211 , G06F18/214 , G06N3/04 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种集成多组学特征的DNA甲基化预测方法,包括确定待预测CpG位点,获取癌旁组织中CpG位点的多组学特征集,获取癌组织中CpG位点的甲基化特征集,基于Pearson相关系数分别计算癌组织CpG位点的甲基化特征与癌旁组织的miRNA、mRNA、甲基化特征之间的相关系数,根据相关系数的取值分别选择K个miRNA、Q个mRNA、L个甲基化特征,并构建多组学相关特征集,基于深度神经网络构建DNA甲基化预测模型,根据多组学相关特征集对DNA甲基化预测模型进行训练,计算训练后的DNA甲基化预测模型的评估指标,当评估指标满足阈值时获取评估后的DNA甲基化预测模型,根据评估后的DNA甲基化预测模型对癌组织的甲基化进行预测。提高了DNA甲基化的预测准确性。