-
公开(公告)号:CN112195233B
公开(公告)日:2023-09-01
申请号:CN202011074475.7
申请日:2020-10-09
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6883 , C12N15/11
摘要: 本发明公开一种与猪脐疝性状相关的SNP分子标记及筛选方法和应用。所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在序列的第101位碱基处的R是T或C,该突变导致上述序列的核苷酸多态性。如此,可通过在体外采用基因芯片技术检测猪的基因型,作为非诊断目的的评判猪是否具有脐疝性状,与目前的PCR‑RFLP等方法相比,本发明具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。
-
公开(公告)号:CN111118177B
公开(公告)日:2021-07-02
申请号:CN202010075877.2
申请日:2020-01-22
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪性成熟期性状相关SNP分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,筛选得到一种与猪性成熟期相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位碱基处存在一个A/C的等位基因突变,当序列第51位核苷酸为C时,有利于猪拥有更长的性成熟期。
-
公开(公告)号:CN112195233A
公开(公告)日:2021-01-08
申请号:CN202011074475.7
申请日:2020-10-09
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6883 , C12N15/11
摘要: 本发明公开一种与猪脐疝性状相关的SNP分子标记及筛选方法和应用。所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在序列的第101位碱基处的R是T或C,该突变导致上述序列的核苷酸多态性。如此,可通过在体外采用基因芯片技术检测猪的基因型,作为非诊断目的的评判猪是否具有脐疝性状,与目前的PCR‑RFLP等方法相比,本发明具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。
-
公开(公告)号:CN110484631A
公开(公告)日:2019-11-22
申请号:CN201910719346.X
申请日:2019-08-01
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪性成熟期性状相关的InDel分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,得到一种与猪性成熟期性状相关InDel的分子标记,本发明的分子标记为猪15号染色体上94356743bp处发生的缺失,由原先的AG缺失为A。当个体基因型为AA时,有利于个体拥有更长的性成熟期。公开了筛选与猪性成熟期性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用。本发明为猪性成熟期的标记辅助选择提供了一个新的InDel分子标记。
-
公开(公告)号:CN111154889B
公开(公告)日:2021-08-03
申请号:CN202010048151.X
申请日:2020-01-16
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11 , G16B20/20 , G16B20/30
摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及一种与猪体重相关的SNP分子标记及其应用和获取方法,本申请的方法通过提取猪的总DNA,对总DNA进行质量控制、分析得到基因型数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,得到一种与猪体重相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位的碱基处存在一个T/G的等位基因突变,导致所示序列的核苷酸产生多态性,当SEQ ID NO:1上的第51位核苷酸为T时,猪体重更重。
-
公开(公告)号:CN110512006A
公开(公告)日:2019-11-29
申请号:CN201910719200.5
申请日:2019-08-01
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪毛色性状相关的SNP分子标记。该SNP分子标记的基因片段的登陆号为rs339614828,通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,得到一种与猪毛色性状相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位的碱基处存在一个G/A的等位基因突变,导致所示序列的核苷酸产生多态性,当SEQ ID NO:1上的第51位核苷酸为A时,有利于猪拥有较浅的毛色。
-
公开(公告)号:CN111154889A
公开(公告)日:2020-05-15
申请号:CN202010048151.X
申请日:2020-01-16
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11 , G16B20/20 , G16B20/30
摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及一种与猪体重相关的SNP分子标记及其应用和获取方法,本申请的方法通过提取猪的总DNA,对总DNA进行质量控制、分析得到基因型数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,得到一种与猪体重相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位的碱基处存在一个T/G的等位基因突变,导致所示序列的核苷酸产生多态性,当SEQ ID NO:1上的第51位核苷酸为T时,猪体重更重。
-
公开(公告)号:CN110484630A
公开(公告)日:2019-11-22
申请号:CN201910719199.6
申请日:2019-08-01
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及克隆自CNV片段的与猪毛色性状相关的分子标记。该分子标记通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,根据全基因组关联分析得到一种与猪毛色性状相关的CNV分子标记,即Chr 7:57026801-57031600所示的序列片段。该片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,当个体拥有该片段的多拷贝时,有利于个体拥有白色毛色。公开了筛选与猪毛色性状相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪毛色性状的标记辅助选择提供了一个新的CNV分子标记。
-
公开(公告)号:CN111118177A
公开(公告)日:2020-05-08
申请号:CN202010075877.2
申请日:2020-01-22
申请人: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪性成熟期性状相关SNP分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,筛选得到一种与猪性成熟期相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位碱基处存在一个A/C的等位基因突变,当序列第51位核苷酸为C时,有利于猪拥有更长的性成熟期。
-
公开(公告)号:CN110273011B
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN201910705906.6
申请日:2019-07-24
申请人: 华中农业大学
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪体长相关的InDel分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,得到一种与猪体长性状相关的分子标记,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51‑52位碱基处存在一个AT/A的碱基缺失。当个体拥有该InDel时,具有更小的体长。本发明公开了筛选与猪体长相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。为猪体长的标记辅助选择提供了一个新的InDel分子标记资源。
-
-
-
-
-
-
-
-
-