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公开(公告)号：CN111315884B
公开(公告)日：2024-03-29
申请号：CN201880072570.8
申请日：2018-09-07
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 杰西卡·里奇曼 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 爱德华多·莫拉莱斯 , 罗德里戈·奥蒂兹 , 尼古拉斯·奥登尼斯 , 胡安·吉梅内斯 , 克里斯蒂安·布拉沃 , 纳塔利娅·乔西亚 , 爱德华多·奥利瓦雷斯 , 路易斯·里昂 , 保罗·科瓦鲁比阿斯 , 费利佩·塞普尔维达 , 费利佩·梅利斯
IPC分类号： C12N15/10 , C12Q1/6806 , C40B40/06 , C12Q1/689
摘要： 诸如用于制备如下一代测序的测序用归一化的文库的方法和/或系统的实施方式，可以包括以下一项或多项：生成一个或多个归一化的扩增子文库；生成一个或多个归一化的微生物群落相关联文库；和/或生成与扩增子相关联测序和微生物群落相关联测序相关联的一个或多个归一化的组合序列文库。
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公开(公告)号：CN107708716B
公开(公告)日：2022-12-06
申请号：CN201680034679.3
申请日：2016-04-13
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 杰西卡·里奇曼 , 斯亚沃什·瑞兹万·贝赫巴哈尼
摘要： 一种用于至少一个受试者中的微生物组分类学特征相关的状况的表征、诊断和治疗中的至少一种的方法，该方法包括：接收来自受试者群体的生物样品的聚合集；生成受试者群体的微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种；基于从微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种提取的特征生成状况的表征；基于该表征生成被配置为矫正状况的疗法模型；以及在与受试者相关联的输出设备，基于表征和疗法模型为受试者安排疗法。
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公开(公告)号：CN108699586B
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN201780016156.0
申请日：2017-03-07
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 卡塔利娜·瓦尔迪维亚 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 杰西卡·里奇曼
IPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/04 , G16B35/00 , G16B40/00 , G16B50/00 , G16B50/50 , G16C20/60 , G16H10/40 , G16H20/00 , G16H20/10 , G16H40/67 , G16H50/20 , G16H50/50
摘要： 用于针对使用者表征与口相关病症的系统和方法的实施方案可以包括如下中的一项或更多项：处理网络，所述处理网络能够操作以收集含有来自使用者集合的物质的容器，所述处理网络包括能够操作以通过对物质进行测序来确定微生物序列的测序系统；微生物群系表征系统，所述微生物群系表征系统能够操作以基于微生物序列确定微生物群系组成数据集和微生物群系功能多样性数据集，收集与所述使用者集合的与口相关病症相关联的补充数据集；并将补充数据和从微生物群系组成数据和微生物群系功能多样性数据提取的特征转化成与口相关病症的表征模型；和/或治疗系统，基于使用表征模型针对与口相关病症对使用者进行表征，所述治疗系统能够操作以促进对使用者的治疗。
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公开(公告)号：CN107708714B
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN201680033334.6
申请日：2016-04-13
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 杰西卡·里奇曼 , 斯亚沃什·瑞兹万·贝赫巴哈尼
IPC分类号： G16B40/00 , G16B50/00 , C12Q1/6883 , C12Q1/689 , A61K35/741 , A61P5/00
摘要： 一种用于至少一个受试者中的内分泌系统状况的表征、诊断和治疗中的至少一种的方法，该方法包括：接收来自受试者群体的生物样品的聚合集；生成受试者群体的微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种；基于从微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种提取的特征生成内分泌系统状况的表征；基于该表征生成被配置为矫正内分泌系统状况的疗法模型；以及在与受试者相关联的输出设备，基于表征和疗法模型为受试者安排疗法。
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公开(公告)号：CN108350510B
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN201680065000.7
申请日：2016-09-09
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 杰西卡·里奇曼 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 斯亚沃什·瑞兹万·贝赫巴哈尼
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/70 , C12Q1/6895 , C12Q1/6883 , G16B40/20 , G16H50/50 , G16H50/20 , G16B30/00 , G16B40/00 , G16B20/00
摘要： 本发明提供了通过表征个体的微生物群系、监测所述微生物群系的影响来检测一个或更多个胃肠问题和/或确定、显示或促进对胃肠问题的治疗的方法、组合物和系统。还提供了用于生成和比较微生物群系组成和/或功能多样性数据集的方法、组合物和系统。还提供了用于生成针对便秘问题、腹泻问题、痔疮问题、腹胀问题以及乳糖不耐受问题的表征模型和/或治疗模型的方法、组合物和系统。
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公开(公告)号：CN107849616B
公开(公告)日：2022-03-29
申请号：CN201680034379.5
申请日：2016-04-13
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 杰西卡·里奇曼 , 斯亚沃什·瑞兹万·贝赫巴哈尼
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6895 , G01N33/48 , G01N33/569
摘要： 一种用于至少一个受试者中的微生物组来源的功能特征相关的状况的表征、诊断和治疗中的至少一种的方法，该方法包括：接收来自受试者群体的生物样品的聚合集；生成受试者群体的微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种；基于从微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种提取的特征生成状况的表征；基于该表征生成被配置为矫正状况的疗法模型；以及在与受试者相关联的输出设备，基于表征和疗法模型为受试者安排疗法。
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公开(公告)号：CN111315884A
公开(公告)日：2020-06-19
申请号：CN201880072570.8
申请日：2018-09-07
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 杰西卡·里奇曼 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 爱德华多·莫拉莱斯 , 罗德里戈·奥蒂兹 , 尼古拉斯·奥登尼斯 , 胡安·吉梅内斯 , 克里斯蒂安·布拉沃 , 纳塔利娅·乔西亚 , 爱德华多·奥利瓦雷斯 , 路易斯·里昂 , 保罗·科瓦鲁比阿斯 , 费利佩·塞普尔维达 , 费利佩·梅利斯
IPC分类号： C12N15/10 , C12Q1/6806 , C40B40/06 , C12Q1/689
摘要： 诸如用于制备如下一代测序的测序用归一化的文库的方法和/或系统的实施方式，可以包括以下一项或多项：生成一个或多个归一化的扩增子文库；生成一个或多个归一化的微生物群落相关联文库；和/或生成与扩增子相关联测序和微生物群落相关联测序相关联的一个或多个归一化的组合序列文库。
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公开(公告)号：CN111278995A
公开(公告)日：2020-06-12
申请号：CN201880070585.0
申请日：2018-08-28
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 伊丽莎白·比克 , 萨拉·W·伯德 , 路易斯·里昂 , 帕梅拉·A·涅托 , 维克多·阿里格利亚-梅拉 , 克瑞斯顿·布拉沃 , 胡安·P·卡德纳斯 , 保罗·科瓦鲁比阿斯 , 萨拉·L·古普塔 , 基拉·哈曼 , 胡安·吉梅内斯 , 费利佩·梅利斯-阿科斯 , 卡米拉·F·纳瓦斯 , 哈罗德·努尼兹 , 爱德华多·奥利瓦雷斯 , 尼古拉斯·奥尔登-爱妮珊丝 , 弗朗西斯科·J·欧萨顿 , 伊格纳西奥·瓦拉斯 , 帕特里夏·维拉-沃夫 , 唐娜·玛丽·B·汉高 , 劳伦斯·克拉尔 , 纳撒尼尔·A·沃尔顿 , 阿曼达·莫顿 , 胡安·P·布斯塔曼特 , 夸西·阿达 , 格雷厄姆·盖斯 , 卡蒂亚·索托-里贝 , 胡安·A·乌加尔 , 爱德华多·H·莫拉莱斯 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 杰西卡·里奇曼
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/70 , C12Q1/6883 , C12Q1/6886 , G16B30/00
摘要： 用于表征一种或多种女性生殖系统有关状况的方法和/或系统的实施方式可包括：确定与受试者集合相关联的微生物数据集；和/或基于所述微生物数据集，执行与一种或多种女性生殖系统有关状况相关联的表征过程，其中执行表征过程可以额外地或替代地包括，对一种或多种女性生殖系统有关状况执行女性生殖系统有关表征过程，和/或确定一种或多种疗法。
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公开(公告)号：CN111201324B
公开(公告)日：2024-03-29
申请号：CN201880066020.5
申请日：2018-10-09
申请人： 普梭梅根公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869
摘要： 方法和/或系统(例如，用于改进的单分子测序，等)的实施方式可以包括制备与目标核酸序列集合相关联的基于唯一分子标识符(UMI)的分子集合；基于所述基于UMI的分子集合和与所述目标核酸序列集合相应的(例如，包括，等)核酸分子集合促进标签化核酸分子集合的生成(例如，生成，等)；和/或使用所述标签化核酸分子集合促进(例如，执行，等)单分子测序。
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公开(公告)号：CN107835692B
公开(公告)日：2022-08-02
申请号：CN201680034024.6
申请日：2016-04-13
申请人： 普梭梅根公司
发明人： 扎迦利·阿普特 , 丹尼尔·阿尔莫纳西德 , 杰西卡·里奇曼 , 斯亚沃什·瑞兹万·贝赫巴哈尼
IPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/689 , C12Q1/04 , A61K35/74 , A61K35/741 , A61P17/00 , A61P17/10 , G16B20/30 , G16B40/30 , G16B40/20 , G16B5/00
摘要： 一种用于至少一个受试者中的皮肤系统状况的表征、诊断和治疗中的至少一种的方法，该方法包括：接收来自受试者群体的生物样品的聚合集；生成受试者群体的微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种；基于从微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种提取的特征生成皮肤系统状况的表征；基于该表征生成被配置为矫正皮肤系统状况的疗法模型；以及在与受试者相关联的输出设备，基于表征和疗法模型为受试者安排疗法。
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