公开(公告)号：CN118707014A

公开(公告)日：2024-09-27

申请号：CN202410620989.X

申请日：2024-05-20

申请人： 暨南大学 ,  广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

发明人： 丁郁 ,  冯颖 ,  吴清平 ,  王涓 ,  陈敏玲 ,  尚玉婷 ,  李佳珣 ,  梁欣敏 ,  秦科元 ,  陈谋通 ,  吴诗

IPC分类号： G01N30/86 ,  G01N30/02 ,  G01N30/72 ,  G06N3/045 ,  G06N20/00

摘要： 本发明公开了一种机器学习辅助非靶向代谢组学筛选抑制呕吐毒素合成的特征代谢物的方法。本发明从机器学习辅助非靶向代谢组学筛选生物标记物的角度出发，利用随机森林和神经网络的组合模型，克服了深度学习“黑箱”问题，在五折交叉验证中，选取平均分类准确率最高的模型，识别在分类最重要特征排序前12并重复出现四次以上的代谢物。然后通过代谢通路富集分析，锁定能够通路中的关键代谢物，缩小生物标志物范围。最后外源添加验证，筛选能够抑制呕吐毒素合成的代谢物。本发明技术可应用于食品工业、养殖业、以及临床上致病微生物及其毒素的高效识别与防控。