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公开(公告)号：CN118910330A
公开(公告)日：2024-11-08
申请号：CN202411086453.0
申请日：2024-08-08
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/70 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11 , C12R1/93
摘要： 本发明公开了一种基于三代靶向测序检测RNA病毒的组合物、试剂盒及其应用，属于生物检测技术领域。本发明中的检测包括如下步骤：S1、提取RNA病毒核酸后，进行逆转录，得到cDNA；S2、使用上述组合物对cDNA进行扩增，得到扩增产物，扩增产物经处理后，建库，得到混合文库；S3、将混合文库中的扩增产物连接接头序列，得到待测样品；S4、对待测样品进行测序，并分析检测结果。本发明能同时扩增75种病原微生物，然后采用三代靶向测序，能快速准确地对上述75种病原微生物进行区分鉴定。
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公开(公告)号：CN118726624A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202411043510.7
申请日：2024-07-31
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6883 , C12N15/11
摘要： 本发明属于生物医学技术领域，具体公开了一种用于检测结核合并感染的试剂盒，该试剂盒可实现白色念珠菌、黑曲霉、胞内分枝杆菌、铜绿假单胞菌、烟曲霉、光滑念珠菌、肺炎克雷伯菌、肺炎链球菌以及龟分枝杆菌、鼻疽诺卡菌、脆弱拟杆菌、卡他莫拉菌、米勒链球菌、苏云金芽孢杆菌、咽峡炎链球菌、中间链球菌、构巢曲霉、黄曲霉、克柔念珠菌、米曲霉等44个病原体的检测，覆盖了结核合并感染的热点和罕见病原体；其中试剂盒优选包括36条特异性引物(即TB1‑F～TB18‑R)，该引物组合更为精简且能够提升结核合并感染的检出能力。利用本发明试剂盒的病原体检出结果，有助于临床针对性用药，对实现个体化有效治疗具有重要意义。
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公开(公告)号：CN114613440A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210320620.8
申请日：2022-03-29
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
摘要： 本发明属于病原微生物检测技术领域，公开了一种基于长读长测序数据的病原微生物分析方法，具体包括：建立纠错参考序列库，将质控后的测序数据比对至纠错参考序列库校正，并在校正后合并相似度高的序列，再比对至病原微生物鉴定数据库得到微生物检出清单。本发明通过对测序数据的校正和合并，有效提高了数据分析速度，并有效降低了长度长测序数据结果的假阳性，实现病原微生物的快速、准确检出。
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公开(公告)号：CN118308502A
公开(公告)日：2024-07-09
申请号：CN202410555686.4
申请日：2024-05-07
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6869 , C12R1/32
摘要： 本发明公开了检测结核分枝杆菌耐药基因的引物组、试剂盒及方法，其中耐药基因包括rpoB、katG、inhA、ahpC、embB、embA、pncA、rrs、rpsL、gyrA、gyrB、eis、rv0678、atpE、rplC、rrl、ddn、ethA、thyA和folC，引物组至少包括如SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:52所示的引物；本发明将多重PCR扩增技术与纳米孔测序技术相结合，通过靶向捕捉耐药基因后进行高通量测序，从而实现耐药突变的检测。本发明能够同时提供20种耐药基因目标区域内所有SNP位点的突变信息，且耐药性预测范围包含常见一线、二线抗结核药物以及贝达喹啉、德拉马尼、普托马尼等抗结核新药，对结核分枝杆菌耐药性判断具有价值。
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公开(公告)号：CN116189774A
公开(公告)日：2023-05-30
申请号：CN202310319074.0
申请日：2023-03-29
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC分类号： G16B30/00 , C12Q1/6869 , G16B40/00
摘要： 本发明公开了一种基于基因组序列的超多重PCR阳性评估方法，该方法包括以下步骤：截取每个物种基因组上与其靶区域对应的区段，建立区段与物种的对应关系，并构建索引；将多重PCR的测序结果比对至索引上，获取比对至每个区段的reads数；根据每个物种设计的靶区域数和实际检出的靶标数目引入置信度计算公式，并根据每个物种的置信度确认是否为真实阳性检出。本发明通过引入特定的置信度计算公式，可有效消除测序结果中由非特异性扩增、或引物保守度不高等因素导致的假阳性，提高检测准确性。
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公开(公告)号：CN115851891A
公开(公告)日：2023-03-28
申请号：CN202211506377.5
申请日：2022-11-29
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
摘要： 本发明公开了一种超多重特异性PCR引物组设计方法和系统，所述方法包括病原微生物基因序列的获取、参考基因序列的筛选、基因序列的片段化、基因序列的比对、引物设计及优化等过程。通过本发明所述方法获得的引物组特异性高，检测灵敏度更优，检测精度更高，且可以实现对细菌、真菌、寄生虫、病毒和耐药基因的检测。
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公开(公告)号：CN115786547A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202211198401.3
申请日：2022-09-29
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/70 , C12Q1/686 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了用于病原微生物检测的引物组、试剂盒及其应用方法，所述引物组包括细菌通用检测引物组、分枝杆菌引物组、支原体螺旋体检测引物组、立克次体检测引物组、真菌通用检测引物组和病毒通用检测引物组，具体的引物序列如SEQ ID NO.1～98所示。本发明提供的引物组可以实现同时对细菌、真菌和病毒的检测，且检测灵敏度高，准确度高；另外，配合引物组应用方法，在4‑6小时即可完成整个检测过程，实现了病原微生物的快速、即时检测。
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公开(公告)号：CN116445588A
公开(公告)日：2023-07-18
申请号：CN202310335680.1
申请日：2023-03-28
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12Q1/6888 , C12Q1/70 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公开了用于病原微生物快速检测的定量参考品和检测方法，本发明提供的定量参考品的序列与任意物种的核酸序列均不重叠，并基于该定量参考品提供了一种病原微生物快速检测方法。本发明通过引入定量参考品，在建库阶段即可通过样本浓度和毛细管电泳结果直观判断建库是否成功，极大缩短了失败样本判断时间与成本，进而缩短实验周期；而且本发明方法可用于检测含有人源基因组DNA的核酸样本，不仅检出限低，且可实现大量不同类型病原微生物的同时检出，检测时间也可缩短至4‑6h，对病原微生物的快速即时检测具有重要意义。
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公开(公告)号：CN116218955A
公开(公告)日：2023-06-06
申请号：CN202310324961.7
申请日：2023-03-29
申请人： 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 本发明公开了用于病原微生物检测的超多重PCR建库试剂盒和检测方法，本发明通过限定试剂盒中引物3’末端的碱基组成来降低多重引物的复杂性与引物间可结合后的延伸性，以避免引物数量过高引起的非特异性扩增，并通过限制位于引物5’端的通用序列结构，有效解决了多重扩增中易出现引物二聚体或多聚体、多重扩增引物干扰、扩增效率差、扩增偏好大与中靶产物比例低的问题；通过上述试剂盒进行病原微生物检测不仅提高了建库质量，而且有效缩短检测时间，对病原微生物的快速即时检测具有重要意义。
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