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公开(公告)号：CN108384885B
公开(公告)日：2019-12-17
申请号：CN201810504433.9
申请日：2018-05-23
申请人： 江西省科学院生物资源研究所 , 南京林业大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种香樟SSR引物组合物及其品种鉴定方法，用于香樟品种的快速分子检测与鉴定，属于植物新品种分子鉴定领域。本发明设计了4对SSR引物，并利用它们成功构建了11个香樟品种指纹图谱，可快速、准确地区分各香樟品种。本发明基于4对SSR引物，进行一次PCR扩增反应，利用8％聚丙烯酰胺凝胶进行电泳，利用引物组合法，可直接根据产物的片段进行判断。本发明可直接应用于香樟不同品种的分子鉴定，具有很好的实用性。
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公开(公告)号：CN110724760A
公开(公告)日：2020-01-24
申请号：CN201911215058.7
申请日：2019-12-02
申请人： 江西省科学院生物资源研究所 , 南京林业大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了香樟核基因组SSR分子标记的多态性引物及其应用，属于林业分子生物学技术领域，引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.14所示，将其应用在香樟品种鉴定、古樟群体遗传结构和资源遗传多样性分析中的应用中，包括基因组DNA的提取、PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳及数据分析的步骤。本发明对18个古樟群体186个个体进行了遗传结构和遗传多样性研究，并根据香樟现有的遗传结构和遗传多样性格局，分析了可能形成的原因，为野生香樟资源保护利用提供理论依据。SSR分子标记重复性好，能够全面揭示香樟遗传多样性真实水平。
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公开(公告)号：CN110760610A
公开(公告)日：2020-02-07
申请号：CN201911216302.1
申请日：2019-12-02
申请人： 南京林业大学 , 江西省科学院生物资源研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物及其应用，属于林业分子生物学技术领域。本发明筛选了11对香樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物，将其应用在古樟遗传多样性分析和古樟谱系分析中，基于叶绿体单倍型分析显示，不同单倍型分布差异明显，大部分单倍型只存在于特定的群体中，只有少数单倍型为共享单倍型，表明单倍型间存在一定的地理分化。18个古樟群体的遗传分化系数Fst为0.212，基因流Nm为0.929，表明古樟群体间存在中等的基因流。本发明的SNP分子标记重复性好，能够全面揭示香樟遗传多样性真实水平，为野生香樟资源保护利用提供理论依据。
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公开(公告)号：CN110724760B
公开(公告)日：2021-03-19
申请号：CN201911215058.7
申请日：2019-12-02
申请人： 江西省科学院生物资源研究所 , 南京林业大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了香樟核基因组SSR分子标记的多态性引物及其应用，属于林业分子生物学技术领域，引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.14所示，将其应用在香樟品种鉴定、古樟群体遗传结构和资源遗传多样性分析中的应用中，包括基因组DNA的提取、PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳及数据分析的步骤。本发明对18个古樟群体186个个体进行了遗传结构和遗传多样性研究，并根据香樟现有的遗传结构和遗传多样性格局，分析了可能形成的原因，为野生香樟资源保护利用提供理论依据。SSR分子标记重复性好，能够全面揭示香樟遗传多样性真实水平。
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公开(公告)号：CN108384885A
公开(公告)日：2018-08-10
申请号：CN201810504433.9
申请日：2018-05-23
申请人： 江西省科学院生物资源研究所 , 南京林业大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种香樟SSR引物组合物及其品种鉴定方法，用于香樟品种的快速分子检测与鉴定，属于植物新品种分子鉴定领域。本发明设计了4对SSR引物，并利用它们成功构建了11个香樟品种指纹图谱，可快速、准确地区分各香樟品种。本发明基于4对SSR引物，进行一次PCR扩增反应，利用8％聚丙烯酰胺凝胶进行电泳，利用引物组合法，可直接根据产物的片段进行判断。本发明可直接应用于香樟不同品种的分子鉴定，具有很好的实用性。
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公开(公告)号：CN110735001B
公开(公告)日：2021-03-19
申请号：CN201911215050.0
申请日：2019-12-02
申请人： 江西省科学院生物资源研究所 , 南京林业大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了香樟核基因组SNP分子标记的多态性引物及其应用，属于林业分子生物学技术领域。包括12对香樟核基因组SNP分子标记的多态性引物，引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.24所示，将其应用在香樟品种鉴定、古樟群体遗传结构和资源遗传多样性分析中的应用中，通过提取不同品种香樟的基因组DNA、PCR扩增、HRM分析、收集数据，对18个古樟群体186个个体进行了遗传结构和遗传多样性研究，并根据香樟现有的遗传结构和遗传多样性格局，分析了可能形成的原因，为野生香樟资源保护利用提供理论依据。本发明的SNP分子标记重复性好，能够全面揭示香樟遗传多样性真实水平。
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公开(公告)号：CN110760610B
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN201911216302.1
申请日：2019-12-02
申请人： 南京林业大学 , 江西省科学院生物资源研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物及其应用，属于林业分子生物学技术领域。本发明筛选了11对香樟叶绿体SNP分子标记的多态性引物，将其应用在古樟遗传多样性分析和古樟谱系分析中，基于叶绿体单倍型分析显示，不同单倍型分布差异明显，大部分单倍型只存在于特定的群体中，只有少数单倍型为共享单倍型，表明单倍型间存在一定的地理分化。18个古樟群体的遗传分化系数Fst为0.212，基因流Nm为0.929，表明古樟群体间存在中等的基因流。本发明的SNP分子标记重复性好，能够全面揭示香樟遗传多样性真实水平，为野生香樟资源保护利用提供理论依据。
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公开(公告)号：CN110735001A
公开(公告)日：2020-01-31
申请号：CN201911215050.0
申请日：2019-12-02
申请人： 江西省科学院生物资源研究所 , 南京林业大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了香樟核基因组SNP分子标记的多态性引物及其应用，属于林业分子生物学技术领域。包括12对香樟核基因组SNP分子标记的多态性引物，引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.24所示，将其应用在香樟品种鉴定、古樟群体遗传结构和资源遗传多样性分析中的应用中，通过提取不同品种香樟的基因组DNA、PCR扩增、HRM分析、收集数据，对18个古樟群体186个个体进行了遗传结构和遗传多样性研究，并根据香樟现有的遗传结构和遗传多样性格局，分析了可能形成的原因，为野生香樟资源保护利用提供理论依据。本发明的SNP分子标记重复性好，能够全面揭示香樟遗传多样性真实水平。
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公开(公告)号：CN107099614B
公开(公告)日：2019-09-27
申请号：CN201710535452.3
申请日：2017-07-04
申请人： 南京林业大学 , 江西省科学院生物资源研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物及检测方法。本发明的引物共8对，其中7对SNP引物组合可以用于构建樟树的指纹图谱。本发明利用樟树转录组数据开发的SNP引物能够对不同樟树进行基因分型，并且本发明操作方法简单，通量高，成本低。此外，本发明开发的7对SNP引物构建了不同樟树的指纹图谱，验证的8个SNP位点还可以用来分子标记辅助育种，遗传多样性研究，基于SNP的关联分析，以及用于种质资源鉴定与分类等。
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公开(公告)号：CN107099614A
公开(公告)日：2017-08-29
申请号：CN201710535452.3
申请日：2017-07-04
申请人： 南京林业大学 , 江西省科学院生物资源研究所
摘要： 本发明公开了一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物及检测方法。本发明的引物共8对，其中7对SNP引物组合可以用于构建樟树的指纹图谱。本发明利用樟树转录组数据开发的SNP引物能够对不同樟树进行基因分型，并且本发明操作方法简单，通量高，成本低。此外，本发明开发的7对SNP引物构建了不同樟树的指纹图谱，验证的8个SNP位点还可以用来分子标记辅助育种，遗传多样性研究，基于SNP的关联分析，以及用于种质资源鉴定与分类等。
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