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公开(公告)号：CN113241116A
公开(公告)日：2021-08-10
申请号：CN202110466042.4
申请日：2021-04-28
申请人： 浙江工业大学
摘要： 一种基于残基间距离优化的差分进化蛋白质结构预测方法，在差分进化算法的框架下，首先，初始化种群，根据距离信息构建能量函数；其次，对种群中的构象进行交叉变异，探测构象空间，然后对当前构象进行距离优化，并根据能量进行选择操作，更新种群；最后，输出种群中能量最低的构象作为预测结果。基于残基间距离优化的差分进化蛋白质结构预测方法构建了基于距离信息的能量模型，缓解了传统能量不精确的问题，在进化算法的框架下使用距离优化的方法加强局部探测，提高了蛋白质结构预测方法的预测精度与效率。本发明提供了一种基于残基间距离优化的差分进化蛋白质结构预测方法，能有效提高蛋白质结构预测的精度和效率。
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公开(公告)号：CN109300503B
公开(公告)日：2021-08-03
申请号：CN201810993709.4
申请日：2018-08-29
申请人： 浙江工业大学
摘要： 一种全局和局部下界估计协同的群体蛋白质结构预测方法，在差分进化算法框架下，首先，通过计算当前种群中每个构象个体的支撑向量建立能量模型的全局下界估计模型；然后，针对每个测试构象，选取与其邻近的部分构象构建邻近构象子种群，然后从其中随机选取构象指导变异过程；其次，根据与测试构象最近的构象的支撑向量计算能量局部下界估计值，并根据全局下界估计模型计算对应的能量全局下界估计值；最后选取能量全局和局部下界估计值中的较低者来指导构象的选择过程，减少能量函数的评价。本发明提供一种计算代价较低且预测效率较高的全局和局部下界估计协同的群体蛋白质结构预测方法。
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公开(公告)号：CN108564258B
公开(公告)日：2021-08-03
申请号：CN201810246611.2
申请日：2018-03-23
申请人： 浙江工业大学
摘要： 一种基于GIS的城市消防栓管理方法，包括以下步骤：A1、获取所需数据；A2、对获取的数据进行筛选；A3、根据筛选出的数据编写脚本方法；A4、根据编写的脚本方法得出的结果进行初步的分析；A5、将数据导入ArcGIS Pro中；A6、对高程数据进行坡度提取和处理；A7、对供水管网数据进行处理；A8、对地段人口密度进行分析和处理；A9、生成成本数据集；A10、加入脚本，创建网络分析；A11分析生成的网络模型，得出合理的管理方法。本发明结合了GIS，基于实际地形、供水管网的实际分布以及地段人口密度实际分布情况，提出了一种消防栓使用效率较高的城市消防栓的管理方法。
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公开(公告)号：CN106779153B
公开(公告)日：2021-08-03
申请号：CN201611026561.4
申请日：2016-11-15
申请人： 浙江工业大学
摘要： 一种智能立体仓库货位分配优化方法，首先，针对货位分配优化模型，根据货位所在的层和列利用连续的实整数对各货位进行编码，将离散问题为连续的整数优化问题；然后，通过对各货位对应的数字进行随机排序生成初始种群，在每代进化之前，根据目标函数值选出部分最优解，并利用所选最优解之间的平均距离来衡量种群的拥挤度，进而根据拥挤度的变化在不同的搜索阶段动态选择不同的变异策略生成高质量的解；最后，根据编码数字与货位一一对应的关系进行解码，即最优解对应的货位分配方案即为当前最优方案。本发明在实际货位分配优化应用中，可以快速的得到合理的最佳分配方案和其他备用方案。
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公开(公告)号：CN108846256B
公开(公告)日：2021-06-18
申请号：CN201810579186.9
申请日：2018-06-07
申请人： 浙江工业大学
IPC分类号： G16B15/00
摘要： 一种基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法，在进化算法框架下，首先，通过交换构象中的片段生成测试构象；其次，根据序列信息预测目标蛋白的残基接触信息，并设计残基接触能量函数对构象进行打分，通过残基接触能量来指导构象的选择过程，即如果测试构象的能量小于目标构象的能量，则直接接受测试构象，否则进一步比较残基接触能量，若测试构象的残基接触能量较小，则接受，否则以玻尔兹曼概率接受，从而引导算法采样得到能量更低且结构更合理的构象。通过残基接触能量为辅来指导构象选择，从而缓解能量函数不精确导致的预测误差问题。本发明提供一种预测精度较高的基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法。
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公开(公告)号：CN108647486B
公开(公告)日：2021-06-18
申请号：CN201810238662.0
申请日：2018-03-22
申请人： 浙江工业大学
摘要： 一种基于构象多样性策略的蛋白质三维结构预测方法，在遗传算法的框架下，采用Rosetta标准协议；利用遗传算子对构象的loop区域进行操作，增强对loop区域的空间搜索；引入基于蛋白质二级结构信息的多样性指标，结合构象的能量值作为种群更新的选择标准，增强种群多样性的同时降低能量函数不精确带来的不利影响，从而预测出精度更高的近天然态构象。本发明提供一种预测精度较高的基于构象多样性策略的蛋白质三维结构预测方法。
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公开(公告)号：CN108629151B
公开(公告)日：2021-06-18
申请号：CN201810238720.X
申请日：2018-03-22
申请人： 浙江工业大学
IPC分类号： G16B20/20
摘要： 一种基于拉式图的群体蛋白质结构预测方法，首先，根据群体的初始化得到全局搜索后的构象；然后，把初始化后的群体进行交叉变异得到新的群体，增加了群体的多样性信息；其次，合并初始群体和交叉变异后的群体，使用能量函数计算种群个体的能量，挑选优秀的个体组成新的群体；最后，通过从拉氏图中采样更新个体的Loop区域，使用能量函数判断是否接收，输出最终的构象。本发明提供一种预测精度较高的基于拉式图的群体蛋白质结构预测方法。
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公开(公告)号：CN108388970B
公开(公告)日：2021-05-18
申请号：CN201810238719.7
申请日：2018-03-22
申请人： 浙江工业大学
摘要： 一种基于GIS的公交站点选址方法，借助ArcGIS网络分析技术，考虑到道路拥堵情况、道路时段客流量、道路附近人口密度、道路坡度比等因素，结合实际的道路坡度数据、道路附近人口密度数据、道路人流量数据、道路拥堵量数据，基于GIS技术得到合适的公交站点位置。本发明提供一种有效的、站点规范的基于GIS的公交站点选址方法。
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公开(公告)号：CN109360597B
公开(公告)日：2020-12-01
申请号：CN201810862181.7
申请日：2018-08-01
申请人： 浙江工业大学
IPC分类号： G16B15/20
摘要： 一种基于全局和局部策略协作的群体蛋白质结构预测方法，在差分进化算法框架下，针对每个构象，首先执行全局变异策略，实行对构象空间的全局探测，从而得到有潜力的区域；然后执行局部变异策略，对探测得到的区域进行局部搜索，从而得到较优的构象。在全局探测过程中，通过随机选择的构象进行片段交换同时生成测试多个构象，并选择能量最低的测试构象；在局部搜索过程中，选择比目标构象较优的构象指导变异生成多个测试构象，并选择能量较低的构象。通过全局策略和局部策略的写作达到平衡多样性和收敛速度之间的关系。本发明提供一种预测精度和搜索效率均较高的基于全局和局部策略协作的群体蛋白质结构预测方法。
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