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公开(公告)号:CN114574615B
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN202210131349.3
申请日:2022-02-14
Applicant: 海南省农业科学院热带园艺研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鉴别海南油茶种质的Indel标记及检测方法。标记的引物序列为:正向引物(5'‑3'):GGAGTCTTGGAATCTAGGTTTGGA;反向引物(5'‑3'):ACAGATTCATTGAGCAGCTCT。利用本发明开发的叶绿体基因片段Indel特异性标记,通过PCR扩增及目标产物测序,可以实现海南岛油茶种质资源的快速、准确鉴别。利用上述引物,待测样品若为海南岛油茶种质资源,则在扩增的目标片段中缺失“GTTAAT”碱基序列,若为岛外油茶种质资源,则为存在“GTTAAT”碱基序列。本发明方法操作简单,结果准确,具有专一性好,灵敏度高等优点。
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公开(公告)号:CN114574615A
公开(公告)日:2022-06-03
申请号:CN202210131349.3
申请日:2022-02-14
Applicant: 海南省农业科学院热带园艺研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鉴别海南油茶种质的Indel标记及检测方法。标记的引物序列为:正向引物(5'‑3'):GGAGTCTTGGAATCTAGGTTTGGA;反向引物(5'‑3'):ACAGATTCATTGAGCAGCTCT。利用本发明开发的叶绿体基因片段Indel特异性标记,通过PCR扩增及目标产物测序,可以实现海南岛油茶种质资源的快速、准确鉴别。利用上述引物,待测样品若为海南岛油茶种质资源,则在扩增的目标片段中缺失“GTTAAT”碱基序列,若为岛外油茶种质资源,则为存在“GTTAAT”碱基序列。本发明方法操作简单,结果准确,具有专一性好,灵敏度高等优点。
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公开(公告)号:CN114574614A
公开(公告)日:2022-06-03
申请号:CN202210131330.9
申请日:2022-02-14
Applicant: 海南省农业科学院热带园艺研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及越南油茶(Camellia vietnamensis)、香花油茶(C.osmantha)、小果油茶(即单籽油茶,C.oleifera var.monosperma)、油茶(即普通油茶,C.oleifera)的鉴定方法。该方法包括扩增引物ycf1‑5,正向序列(5'‑3'):TGACCTCTTAACCAGTTTTTCCA;反向序列(5'‑3'):TGGATTATCAAGGGCATTCCGT。用于检测SNP1、SNP2和InDel 1。扩增引物ZDJ‑190,正向序列(5'‑3'):AAAGAGCGTGGAGGTTCGAG;反向序列(5'‑3'):GACTGGGTGGTCGAGTCATG,用于检测InDel 2位点。当经扩增产物测序后,香花油茶种质材料引物ycf1‑5产物列序中的SNP1和SNP2上表现为“T”碱基;InDel 1缺失“TCTTTT”序列者为小果油茶。InDel 2位点表现为缺失“AGTAC”序列者为越南油茶,不缺失者为普通油茶。据此,可有效检测鉴定越南油茶、香花油茶、小果油茶和普通油茶资源,为相关油茶资源的分类鉴定与分子育种选择提供了技术支撑。
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公开(公告)号:CN114574614B
公开(公告)日:2025-02-07
申请号:CN202210131330.9
申请日:2022-02-14
Applicant: 海南省农业科学院热带园艺研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及越南油茶(Camellia vietnamensis)、香花油茶(C.osmantha)、小果油茶(即单籽油茶,C.oleifera var.monosperma)、油茶(即普通油茶,C.oleifera)的鉴定方法。该方法包括扩增引物ycf1‑5,正向序列(5'‑3'):TGACCTCTTAACCAGTTTTTCCA;反向序列(5'‑3'):TGGATTATCAAGGGCATTCCGT。用于检测SNP1、SNP2和InDel 1。扩增引物ZDJ‑190,正向序列(5'‑3'):AAAGAGCGTGGAGGTTCGAG;反向序列(5'‑3'):GACTGGGTGGTCGAGTCATG,用于检测InDel 2位点。当经扩增产物测序后,香花油茶种质材料引物ycf1‑5产物列序中的SNP1和SNP2上表现为“T”碱基;InDel 1缺失“TCTTTT”序列者为小果油茶。InDel 2位点表现为缺失“AGTAC”序列者为越南油茶,不缺失者为普通油茶。据此,可有效检测鉴定越南油茶、香花油茶、小果油茶和普通油茶资源,为相关油茶资源的分类鉴定与分子育种选择提供了技术支撑。
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公开(公告)号:CN116144821A
公开(公告)日:2023-05-23
申请号:CN202211400395.5
申请日:2022-11-09
Applicant: 海南省农业科学院三亚研究院(海南省实验动物研究中心) , 海南省农业科学院热带园艺研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明涉及了植物分子育种领域,具体的是一种油茶自交不亲和雌性决定因子S基因的鉴定方法及配套试剂盒。以待鉴定油茶的cDNA为扩增模板,采用CvS‑RNase‑2引物组中的引物对分别进行PCR扩增,根据扩增产物的有无以及大小确定待鉴定油茶自交不亲和雌性决定因子S基因;引物序列为:正向引物(5'‑3'):TCCGAACACTGCGTTTGCTG;反向引物(5'‑3'):ACAACTAAATCGCCCACGCATA。通过PCR扩增及目标产物的测序,可以实现油茶S基因的检测,系统解析油茶自交不亲和机理奠定基础,并为油茶分子育种选择提供了技术支撑。
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