公开(公告)号：CN101561845A

公开(公告)日：2009-10-21

申请号：CN200810218339.3

申请日：2008-12-12

Applicant: 深圳华大基因研究院 ,  深圳华大基因科技有限公司

Inventor： 李俊 ,  白寅琪 ,  李瑞强 ,  王俊 ,  杨焕明 ,  汪建

IPC: G06F19/00 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明适用于基因工程领域，提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统，所述方法包括下述步骤：将参考基因集中的所有参考基因定位到目标基因组上，构成基因拷贝座位；根据所述基因拷贝座位，将重叠的基因拷贝聚类到一起，形成模糊位点基因代表座位；根据所述模糊位点代表基因座位，利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域，且敏感度高，复杂度低，避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。

公开(公告)号：CN103270175A

公开(公告)日：2013-08-28

申请号：CN201180062256.X

申请日：2011-01-20

Applicant: 深圳华大基因科技有限公司

Inventor： 郭小森 ,  陈帅 ,  张雪梅 ,  郎继东 ,  李俊 ,  胡雪松 ,  陈聪群

IPC: C12Q1/68 ,  G01N33/00

CPC classification number: C12N15/1082

Abstract: 本发明公开一种检测转基因外源片段插入位点的方法和系统。该方法包括：通过比对确定外源单侧短片段和基因组单侧短片段，并根据外源单侧短片段和基因组单侧短片段的交集确定外源片段在基因组序列中的插入位点。

公开(公告)号：CN103270175B

公开(公告)日：2015-06-24

申请号：CN201180062256.X

申请日：2011-01-20

Applicant: 深圳华大基因科技有限公司

Inventor： 郭小森 ,  陈帅 ,  张雪梅 ,  郎继东 ,  李俊 ,  胡雪松 ,  陈聪群

IPC: C12Q1/68 ,  G01N33/00

CPC classification number: C12N15/1082

Abstract: 本发明公开一种检测转基因外源片段插入位点的方法和系统。该方法包括：通过比对确定外源单侧短片段和基因组单侧短片段，并根据外源单侧短片段和基因组单侧短片段的交集确定外源片段在基因组序列中的插入位点。